Protein–RNA interactions for Protein: P57772

EEFSEC, Selenocysteine-specific elongation factor, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 596 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EEFSECP57772 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
EEFSECP57772 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
EEFSECP57772 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
EEFSECP57772 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
EEFSECP57772 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
EEFSECP57772 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
EEFSECP57772 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
EEFSECP57772 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
EEFSECP57772 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
EEFSECP57772 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
EEFSECP57772 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
EEFSECP57772 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
EEFSECP57772 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
EEFSECP57772 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
EEFSECP57772 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
EEFSECP57772 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
EEFSECP57772 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
EEFSECP57772 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
EEFSECP57772 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
EEFSECP57772 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
EEFSECP57772 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
EEFSECP57772 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
EEFSECP57772 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
EEFSECP57772 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
EEFSECP57772 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
EEFSECP57772 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
EEFSECP57772 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
EEFSECP57772 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
EEFSECP57772 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC26.28■■□□□ 1.8
EEFSECP57772 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC26.27■■□□□ 1.8
EEFSECP57772 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
EEFSECP57772 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC26.27■■□□□ 1.8
EEFSECP57772 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC26.25■■□□□ 1.79
EEFSECP57772 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
EEFSECP57772 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
EEFSECP57772 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
EEFSECP57772 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
EEFSECP57772 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
EEFSECP57772 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
EEFSECP57772 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
EEFSECP57772 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
EEFSECP57772 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
EEFSECP57772 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
EEFSECP57772 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
EEFSECP57772 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
EEFSECP57772 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
EEFSECP57772 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
EEFSECP57772 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
EEFSECP57772 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
EEFSECP57772 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
EEFSECP57772 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
EEFSECP57772 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
EEFSECP57772 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
EEFSECP57772 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
EEFSECP57772 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
EEFSECP57772 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
EEFSECP57772 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC26.15■■□□□ 1.78
EEFSECP57772 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
EEFSECP57772 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
EEFSECP57772 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
EEFSECP57772 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
EEFSECP57772 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
EEFSECP57772 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
EEFSECP57772 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC26.09■■□□□ 1.77
EEFSECP57772 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
EEFSECP57772 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
EEFSECP57772 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
EEFSECP57772 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
EEFSECP57772 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
EEFSECP57772 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
EEFSECP57772 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
EEFSECP57772 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
EEFSECP57772 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
EEFSECP57772 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
EEFSECP57772 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC26.03■■□□□ 1.76
EEFSECP57772 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
EEFSECP57772 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
EEFSECP57772 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
EEFSECP57772 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
EEFSECP57772 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
EEFSECP57772 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
EEFSECP57772 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
EEFSECP57772 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
EEFSECP57772 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
EEFSECP57772 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
EEFSECP57772 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
EEFSECP57772 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
EEFSECP57772 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
EEFSECP57772 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
EEFSECP57772 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
EEFSECP57772 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
EEFSECP57772 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
EEFSECP57772 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
EEFSECP57772 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
EEFSECP57772 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
EEFSECP57772 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
EEFSECP57772 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
EEFSECP57772 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
EEFSECP57772 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.93■■□□□ 1.74
EEFSECP57772 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 75.7 ms