Protein–RNA interactions for Protein: P57738

TCTA, T-cell leukemia translocation-altered gene protein, humanhuman

Predictions only

Length 103 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCTAP57738 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
TCTAP57738 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TCTAP57738 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
TCTAP57738 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
TCTAP57738 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
TCTAP57738 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
TCTAP57738 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
TCTAP57738 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
TCTAP57738 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TCTAP57738 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TCTAP57738 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
TCTAP57738 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
TCTAP57738 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
TCTAP57738 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
TCTAP57738 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
TCTAP57738 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
TCTAP57738 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
TCTAP57738 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
TCTAP57738 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
TCTAP57738 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
TCTAP57738 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
TCTAP57738 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
TCTAP57738 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
TCTAP57738 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
TCTAP57738 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
TCTAP57738 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
TCTAP57738 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
TCTAP57738 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
TCTAP57738 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
TCTAP57738 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
TCTAP57738 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
TCTAP57738 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
TCTAP57738 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
TCTAP57738 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
TCTAP57738 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
TCTAP57738 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
TCTAP57738 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
TCTAP57738 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
TCTAP57738 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
TCTAP57738 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC20.29■□□□□ 0.84
TCTAP57738 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
TCTAP57738 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
TCTAP57738 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
TCTAP57738 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
TCTAP57738 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
TCTAP57738 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
TCTAP57738 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
TCTAP57738 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.83
TCTAP57738 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
TCTAP57738 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
TCTAP57738 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
TCTAP57738 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
TCTAP57738 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
TCTAP57738 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
TCTAP57738 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
TCTAP57738 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
TCTAP57738 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
TCTAP57738 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TCTAP57738 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TCTAP57738 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TCTAP57738 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
TCTAP57738 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
TCTAP57738 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
TCTAP57738 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
TCTAP57738 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
TCTAP57738 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
TCTAP57738 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
TCTAP57738 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
TCTAP57738 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TCTAP57738 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
TCTAP57738 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TCTAP57738 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TCTAP57738 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TCTAP57738 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TCTAP57738 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TCTAP57738 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TCTAP57738 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TCTAP57738 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TCTAP57738 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TCTAP57738 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
TCTAP57738 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TCTAP57738 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TCTAP57738 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TCTAP57738 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
TCTAP57738 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
TCTAP57738 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TCTAP57738 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TCTAP57738 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
TCTAP57738 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
TCTAP57738 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TCTAP57738 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
TCTAP57738 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TCTAP57738 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TCTAP57738 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
TCTAP57738 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC20.05■□□□□ 0.8
TCTAP57738 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC20.05■□□□□ 0.8
TCTAP57738 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
TCTAP57738 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
TCTAP57738 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
TCTAP57738 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.6 ms