Protein–RNA interactions for Protein: P55884

EIF3B, Eukaryotic translation initiation factor 3 subunit B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 814 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EIF3BP55884 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
EIF3BP55884 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
EIF3BP55884 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC28.65■■■□□ 2.18
EIF3BP55884 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
EIF3BP55884 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.18
EIF3BP55884 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC28.64■■■□□ 2.18
EIF3BP55884 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
EIF3BP55884 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
EIF3BP55884 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
EIF3BP55884 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
EIF3BP55884 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
EIF3BP55884 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
EIF3BP55884 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
EIF3BP55884 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
EIF3BP55884 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
EIF3BP55884 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
EIF3BP55884 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
EIF3BP55884 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
EIF3BP55884 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC28.48■■■□□ 2.15
EIF3BP55884 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
EIF3BP55884 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
EIF3BP55884 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
EIF3BP55884 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
EIF3BP55884 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
EIF3BP55884 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
EIF3BP55884 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
EIF3BP55884 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
EIF3BP55884 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
EIF3BP55884 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
EIF3BP55884 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
EIF3BP55884 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
EIF3BP55884 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
EIF3BP55884 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
EIF3BP55884 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
EIF3BP55884 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
EIF3BP55884 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
EIF3BP55884 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
EIF3BP55884 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
EIF3BP55884 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
EIF3BP55884 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
EIF3BP55884 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
EIF3BP55884 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
EIF3BP55884 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
EIF3BP55884 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
EIF3BP55884 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
EIF3BP55884 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
EIF3BP55884 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
EIF3BP55884 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC28.27■■■□□ 2.12
EIF3BP55884 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
EIF3BP55884 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
EIF3BP55884 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC28.26■■■□□ 2.12
EIF3BP55884 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
EIF3BP55884 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
EIF3BP55884 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
EIF3BP55884 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC28.23■■■□□ 2.11
EIF3BP55884 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
EIF3BP55884 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
EIF3BP55884 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
EIF3BP55884 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
EIF3BP55884 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
EIF3BP55884 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
EIF3BP55884 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
EIF3BP55884 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC28.17■■■□□ 2.1
EIF3BP55884 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
EIF3BP55884 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
EIF3BP55884 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
EIF3BP55884 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
EIF3BP55884 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
EIF3BP55884 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
EIF3BP55884 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
EIF3BP55884 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
EIF3BP55884 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
EIF3BP55884 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
EIF3BP55884 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
EIF3BP55884 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
EIF3BP55884 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
EIF3BP55884 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
EIF3BP55884 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
EIF3BP55884 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
EIF3BP55884 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
EIF3BP55884 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
EIF3BP55884 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
EIF3BP55884 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
EIF3BP55884 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
EIF3BP55884 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC28.08■■■□□ 2.09
EIF3BP55884 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
EIF3BP55884 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
EIF3BP55884 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
EIF3BP55884 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
EIF3BP55884 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC28.03■■■□□ 2.08
EIF3BP55884 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
EIF3BP55884 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
EIF3BP55884 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
EIF3BP55884 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.08
EIF3BP55884 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
EIF3BP55884 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
EIF3BP55884 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
EIF3BP55884 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
EIF3BP55884 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
EIF3BP55884 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.3 ms