Protein–RNA interactions for Protein: P55000

SLURP1, Secreted Ly-6/uPAR-related protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 103 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLURP1P55000 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SLURP1P55000 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SLURP1P55000 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SLURP1P55000 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SLURP1P55000 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
SLURP1P55000 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SLURP1P55000 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SLURP1P55000 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SLURP1P55000 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
SLURP1P55000 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
SLURP1P55000 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SLURP1P55000 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SLURP1P55000 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SLURP1P55000 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC21.3■■□□□ 1
SLURP1P55000 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
SLURP1P55000 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
SLURP1P55000 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
SLURP1P55000 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
SLURP1P55000 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SLURP1P55000 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SLURP1P55000 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
SLURP1P55000 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SLURP1P55000 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SLURP1P55000 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SLURP1P55000 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SLURP1P55000 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SLURP1P55000 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SLURP1P55000 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SLURP1P55000 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SLURP1P55000 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
SLURP1P55000 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
SLURP1P55000 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SLURP1P55000 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SLURP1P55000 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
SLURP1P55000 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SLURP1P55000 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SLURP1P55000 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SLURP1P55000 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
SLURP1P55000 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
SLURP1P55000 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
SLURP1P55000 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SLURP1P55000 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
SLURP1P55000 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
SLURP1P55000 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
SLURP1P55000 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SLURP1P55000 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SLURP1P55000 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SLURP1P55000 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SLURP1P55000 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SLURP1P55000 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SLURP1P55000 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SLURP1P55000 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SLURP1P55000 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SLURP1P55000 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
SLURP1P55000 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SLURP1P55000 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
SLURP1P55000 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
SLURP1P55000 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
SLURP1P55000 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
SLURP1P55000 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SLURP1P55000 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SLURP1P55000 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
SLURP1P55000 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SLURP1P55000 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
SLURP1P55000 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
SLURP1P55000 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SLURP1P55000 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SLURP1P55000 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
SLURP1P55000 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
SLURP1P55000 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
SLURP1P55000 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
SLURP1P55000 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
SLURP1P55000 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
SLURP1P55000 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
SLURP1P55000 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
SLURP1P55000 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
SLURP1P55000 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
SLURP1P55000 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC20.97■□□□□ 0.95
SLURP1P55000 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
SLURP1P55000 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
SLURP1P55000 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
SLURP1P55000 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
SLURP1P55000 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
SLURP1P55000 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
SLURP1P55000 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
SLURP1P55000 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
SLURP1P55000 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
SLURP1P55000 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
SLURP1P55000 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
SLURP1P55000 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
SLURP1P55000 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
SLURP1P55000 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
SLURP1P55000 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
SLURP1P55000 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
SLURP1P55000 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
SLURP1P55000 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
SLURP1P55000 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
SLURP1P55000 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
SLURP1P55000 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
SLURP1P55000 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.1 ms