Protein–RNA interactions for Protein: P52294

KPNA1, Importin subunit alpha-5, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 538 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KPNA1P52294 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC29.29■■■□□ 2.28
KPNA1P52294 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
KPNA1P52294 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
KPNA1P52294 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.23■■■□□ 2.27
KPNA1P52294 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
KPNA1P52294 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC29.21■■■□□ 2.27
KPNA1P52294 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
KPNA1P52294 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
KPNA1P52294 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
KPNA1P52294 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC29.19■■■□□ 2.26
KPNA1P52294 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
KPNA1P52294 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
KPNA1P52294 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC29.16■■■□□ 2.26
KPNA1P52294 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.16■■■□□ 2.26
KPNA1P52294 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
KPNA1P52294 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.12■■■□□ 2.25
KPNA1P52294 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
KPNA1P52294 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
KPNA1P52294 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
KPNA1P52294 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
KPNA1P52294 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.07■■■□□ 2.24
KPNA1P52294 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
KPNA1P52294 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
KPNA1P52294 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
KPNA1P52294 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
KPNA1P52294 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.23
KPNA1P52294 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC29.01■■■□□ 2.23
KPNA1P52294 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
KPNA1P52294 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
KPNA1P52294 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
KPNA1P52294 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
KPNA1P52294 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
KPNA1P52294 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
KPNA1P52294 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
KPNA1P52294 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
KPNA1P52294 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
KPNA1P52294 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
KPNA1P52294 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
KPNA1P52294 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
KPNA1P52294 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC28.9■■■□□ 2.22
KPNA1P52294 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
KPNA1P52294 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC28.87■■■□□ 2.21
KPNA1P52294 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC28.86■■■□□ 2.21
KPNA1P52294 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
KPNA1P52294 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
KPNA1P52294 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
KPNA1P52294 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC28.84■■■□□ 2.21
KPNA1P52294 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
KPNA1P52294 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
KPNA1P52294 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
KPNA1P52294 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
KPNA1P52294 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
KPNA1P52294 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
KPNA1P52294 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
KPNA1P52294 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
KPNA1P52294 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC28.8■■■□□ 2.2
KPNA1P52294 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
KPNA1P52294 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC28.76■■■□□ 2.2
KPNA1P52294 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
KPNA1P52294 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
KPNA1P52294 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
KPNA1P52294 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
KPNA1P52294 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
KPNA1P52294 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
KPNA1P52294 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
KPNA1P52294 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
KPNA1P52294 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
KPNA1P52294 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC28.72■■■□□ 2.19
KPNA1P52294 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC28.72■■■□□ 2.19
KPNA1P52294 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC28.72■■■□□ 2.19
KPNA1P52294 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
KPNA1P52294 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
KPNA1P52294 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
KPNA1P52294 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
KPNA1P52294 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
KPNA1P52294 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC28.71■■■□□ 2.19
KPNA1P52294 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
KPNA1P52294 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
KPNA1P52294 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC28.69■■■□□ 2.18
KPNA1P52294 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
KPNA1P52294 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC28.69■■■□□ 2.18
KPNA1P52294 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
KPNA1P52294 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
KPNA1P52294 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.18
KPNA1P52294 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
KPNA1P52294 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.18
KPNA1P52294 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
KPNA1P52294 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
KPNA1P52294 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC28.61■■■□□ 2.17
KPNA1P52294 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
KPNA1P52294 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
KPNA1P52294 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
KPNA1P52294 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
KPNA1P52294 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
KPNA1P52294 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
KPNA1P52294 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
KPNA1P52294 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
KPNA1P52294 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
KPNA1P52294 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC28.55■■■□□ 2.16
KPNA1P52294 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.6 ms