Protein–RNA interactions for Protein: P51512

MMP16, Matrix metalloproteinase-16, humanhuman

Predictions only

Length 607 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MMP16P51512 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
MMP16P51512 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
MMP16P51512 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
MMP16P51512 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
MMP16P51512 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
MMP16P51512 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
MMP16P51512 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC24.33■■□□□ 1.48
MMP16P51512 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
MMP16P51512 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
MMP16P51512 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
MMP16P51512 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
MMP16P51512 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
MMP16P51512 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
MMP16P51512 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
MMP16P51512 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
MMP16P51512 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
MMP16P51512 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
MMP16P51512 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
MMP16P51512 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC24.28■■□□□ 1.48
MMP16P51512 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
MMP16P51512 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
MMP16P51512 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
MMP16P51512 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
MMP16P51512 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
MMP16P51512 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
MMP16P51512 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
MMP16P51512 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
MMP16P51512 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
MMP16P51512 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
MMP16P51512 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
MMP16P51512 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
MMP16P51512 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
MMP16P51512 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
MMP16P51512 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
MMP16P51512 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
MMP16P51512 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
MMP16P51512 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
MMP16P51512 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
MMP16P51512 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
MMP16P51512 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
MMP16P51512 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
MMP16P51512 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
MMP16P51512 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
MMP16P51512 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
MMP16P51512 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
MMP16P51512 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
MMP16P51512 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
MMP16P51512 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
MMP16P51512 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
MMP16P51512 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
MMP16P51512 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC24.14■■□□□ 1.46
MMP16P51512 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
MMP16P51512 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
MMP16P51512 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
MMP16P51512 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
MMP16P51512 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
MMP16P51512 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
MMP16P51512 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
MMP16P51512 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
MMP16P51512 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
MMP16P51512 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
MMP16P51512 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
MMP16P51512 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
MMP16P51512 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
MMP16P51512 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
MMP16P51512 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
MMP16P51512 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
MMP16P51512 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
MMP16P51512 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
MMP16P51512 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
MMP16P51512 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
MMP16P51512 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
MMP16P51512 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
MMP16P51512 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
MMP16P51512 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
MMP16P51512 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC23.99■■□□□ 1.43
MMP16P51512 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
MMP16P51512 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
MMP16P51512 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
MMP16P51512 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
MMP16P51512 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
MMP16P51512 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
MMP16P51512 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
MMP16P51512 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
MMP16P51512 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
MMP16P51512 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
MMP16P51512 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
MMP16P51512 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
MMP16P51512 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
MMP16P51512 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
MMP16P51512 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
MMP16P51512 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC23.86■■□□□ 1.41
MMP16P51512 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
MMP16P51512 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
MMP16P51512 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
MMP16P51512 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
MMP16P51512 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
MMP16P51512 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
MMP16P51512 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
MMP16P51512 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 78.5 ms