Protein–RNA interactions for Protein: P50607

TUB, Tubby protein homolog, humanhuman

Predictions only

Length 506 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBP50607 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC29.23■■■□□ 2.27
TUBP50607 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
TUBP50607 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.26
TUBP50607 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC29.2■■■□□ 2.26
TUBP50607 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC29.19■■■□□ 2.26
TUBP50607 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC29.19■■■□□ 2.26
TUBP50607 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC29.19■■■□□ 2.26
TUBP50607 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
TUBP50607 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
TUBP50607 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
TUBP50607 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
TUBP50607 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
TUBP50607 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
TUBP50607 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
TUBP50607 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
TUBP50607 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
TUBP50607 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
TUBP50607 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
TUBP50607 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
TUBP50607 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
TUBP50607 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
TUBP50607 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
TUBP50607 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC29.03■■■□□ 2.24
TUBP50607 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
TUBP50607 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
TUBP50607 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
TUBP50607 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
TUBP50607 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
TUBP50607 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
TUBP50607 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
TUBP50607 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC29.01■■■□□ 2.23
TUBP50607 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
TUBP50607 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC28.99■■■□□ 2.23
TUBP50607 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
TUBP50607 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
TUBP50607 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
TUBP50607 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
TUBP50607 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
TUBP50607 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
TUBP50607 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
TUBP50607 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC28.95■■■□□ 2.22
TUBP50607 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
TUBP50607 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
TUBP50607 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
TUBP50607 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
TUBP50607 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.91■■■□□ 2.22
TUBP50607 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC28.9■■■□□ 2.22
TUBP50607 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC28.9■■■□□ 2.22
TUBP50607 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
TUBP50607 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.22
TUBP50607 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
TUBP50607 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC28.86■■■□□ 2.21
TUBP50607 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
TUBP50607 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
TUBP50607 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
TUBP50607 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC28.83■■■□□ 2.21
TUBP50607 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
TUBP50607 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
TUBP50607 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
TUBP50607 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
TUBP50607 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
TUBP50607 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC28.79■■■□□ 2.2
TUBP50607 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
TUBP50607 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
TUBP50607 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
TUBP50607 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
TUBP50607 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
TUBP50607 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
TUBP50607 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
TUBP50607 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
TUBP50607 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
TUBP50607 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
TUBP50607 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
TUBP50607 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
TUBP50607 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
TUBP50607 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
TUBP50607 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
TUBP50607 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
TUBP50607 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
TUBP50607 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
TUBP50607 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC28.67■■■□□ 2.18
TUBP50607 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
TUBP50607 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
TUBP50607 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.66■■■□□ 2.18
TUBP50607 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC28.66■■■□□ 2.18
TUBP50607 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
TUBP50607 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
TUBP50607 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
TUBP50607 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
TUBP50607 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
TUBP50607 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
TUBP50607 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC28.61■■■□□ 2.17
TUBP50607 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
TUBP50607 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
TUBP50607 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
TUBP50607 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
TUBP50607 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
TUBP50607 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
TUBP50607 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
TUBP50607 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 95.8 ms