Protein–RNA interactions for Protein: P50395

GDI2, Rab GDP dissociation inhibitor beta, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GDI2P50395 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
GDI2P50395 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
GDI2P50395 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
GDI2P50395 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
GDI2P50395 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC24.79■■□□□ 1.56
GDI2P50395 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
GDI2P50395 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
GDI2P50395 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
GDI2P50395 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
GDI2P50395 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
GDI2P50395 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
GDI2P50395 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
GDI2P50395 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
GDI2P50395 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
GDI2P50395 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
GDI2P50395 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
GDI2P50395 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC24.73■■□□□ 1.55
GDI2P50395 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
GDI2P50395 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
GDI2P50395 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
GDI2P50395 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
GDI2P50395 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
GDI2P50395 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
GDI2P50395 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC24.7■■□□□ 1.54
GDI2P50395 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
GDI2P50395 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
GDI2P50395 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
GDI2P50395 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
GDI2P50395 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
GDI2P50395 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
GDI2P50395 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
GDI2P50395 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
GDI2P50395 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
GDI2P50395 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
GDI2P50395 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
GDI2P50395 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
GDI2P50395 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
GDI2P50395 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
GDI2P50395 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
GDI2P50395 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
GDI2P50395 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
GDI2P50395 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
GDI2P50395 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
GDI2P50395 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
GDI2P50395 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
GDI2P50395 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
GDI2P50395 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
GDI2P50395 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
GDI2P50395 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
GDI2P50395 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
GDI2P50395 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
GDI2P50395 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
GDI2P50395 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
GDI2P50395 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
GDI2P50395 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
GDI2P50395 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
GDI2P50395 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
GDI2P50395 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
GDI2P50395 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
GDI2P50395 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
GDI2P50395 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
GDI2P50395 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
GDI2P50395 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
GDI2P50395 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
GDI2P50395 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.51
GDI2P50395 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
GDI2P50395 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
GDI2P50395 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
GDI2P50395 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
GDI2P50395 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
GDI2P50395 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
GDI2P50395 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
GDI2P50395 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
GDI2P50395 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
GDI2P50395 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
GDI2P50395 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
GDI2P50395 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
GDI2P50395 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
GDI2P50395 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
GDI2P50395 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
GDI2P50395 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
GDI2P50395 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
GDI2P50395 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
GDI2P50395 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
GDI2P50395 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
GDI2P50395 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
GDI2P50395 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
GDI2P50395 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
GDI2P50395 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
GDI2P50395 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
GDI2P50395 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
GDI2P50395 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
GDI2P50395 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
GDI2P50395 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
GDI2P50395 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
GDI2P50395 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
GDI2P50395 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
GDI2P50395 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
GDI2P50395 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
GDI2P50395 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 78.7 ms