Protein–RNA interactions for Protein: P48050

KCNJ4, Inward rectifier potassium channel 4, humanhuman

Predictions only

Length 445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNJ4P48050 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.56■■■■□ 3.12
KCNJ4P48050 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.55■■■■□ 3.12
KCNJ4P48050 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC34.54■■■■□ 3.12
KCNJ4P48050 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.54■■■■□ 3.12
KCNJ4P48050 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.53■■■■□ 3.12
KCNJ4P48050 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC34.53■■■■□ 3.12
KCNJ4P48050 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC34.53■■■■□ 3.12
KCNJ4P48050 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.52■■■■□ 3.12
KCNJ4P48050 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.5■■■■□ 3.11
KCNJ4P48050 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.5■■■■□ 3.11
KCNJ4P48050 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.49■■■■□ 3.11
KCNJ4P48050 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.49■■■■□ 3.11
KCNJ4P48050 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.49■■■■□ 3.11
KCNJ4P48050 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.49■■■■□ 3.11
KCNJ4P48050 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.47■■■■□ 3.11
KCNJ4P48050 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC34.47■■■■□ 3.11
KCNJ4P48050 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC34.46■■■■□ 3.11
KCNJ4P48050 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC34.46■■■■□ 3.11
KCNJ4P48050 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.46■■■■□ 3.11
KCNJ4P48050 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.42■■■■□ 3.1
KCNJ4P48050 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC34.42■■■■□ 3.1
KCNJ4P48050 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC34.4■■■■□ 3.1
KCNJ4P48050 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC34.4■■■■□ 3.1
KCNJ4P48050 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.39■■■■□ 3.1
KCNJ4P48050 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC34.39■■■■□ 3.1
KCNJ4P48050 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.38■■■■□ 3.09
KCNJ4P48050 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC34.37■■■■□ 3.09
KCNJ4P48050 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.35■■■■□ 3.09
KCNJ4P48050 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.34■■■■□ 3.09
KCNJ4P48050 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.34■■■■□ 3.09
KCNJ4P48050 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.33■■■■□ 3.09
KCNJ4P48050 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC34.32■■■■□ 3.08
KCNJ4P48050 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC34.3■■■■□ 3.08
KCNJ4P48050 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.3■■■■□ 3.08
KCNJ4P48050 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.28■■■■□ 3.08
KCNJ4P48050 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.27■■■■□ 3.08
KCNJ4P48050 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.27■■■■□ 3.08
KCNJ4P48050 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.25■■■■□ 3.07
KCNJ4P48050 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC34.23■■■■□ 3.07
KCNJ4P48050 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC34.23■■■■□ 3.07
KCNJ4P48050 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC34.22■■■■□ 3.07
KCNJ4P48050 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.22■■■■□ 3.07
KCNJ4P48050 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.22■■■■□ 3.07
KCNJ4P48050 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.21■■■■□ 3.07
KCNJ4P48050 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC34.19■■■■□ 3.06
KCNJ4P48050 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC34.19■■■■□ 3.06
KCNJ4P48050 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.17■■■■□ 3.06
KCNJ4P48050 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC34.17■■■■□ 3.06
KCNJ4P48050 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC34.15■■■■□ 3.06
KCNJ4P48050 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.14■■■■□ 3.06
KCNJ4P48050 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC34.13■■■■□ 3.05
KCNJ4P48050 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC34.12■■■■□ 3.05
KCNJ4P48050 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC34.12■■■■□ 3.05
KCNJ4P48050 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.11■■■■□ 3.05
KCNJ4P48050 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.1■■■■□ 3.05
KCNJ4P48050 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.09■■■■□ 3.05
KCNJ4P48050 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.09■■■■□ 3.05
KCNJ4P48050 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC34.06■■■■□ 3.04
KCNJ4P48050 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.06■■■■□ 3.04
KCNJ4P48050 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.05■■■■□ 3.04
KCNJ4P48050 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC34.05■■■■□ 3.04
KCNJ4P48050 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC34.05■■■■□ 3.04
KCNJ4P48050 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC34.03■■■■□ 3.04
KCNJ4P48050 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC34.03■■■■□ 3.04
KCNJ4P48050 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.03■■■■□ 3.04
KCNJ4P48050 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC34.02■■■■□ 3.04
KCNJ4P48050 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC33.99■■■■□ 3.03
KCNJ4P48050 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC33.99■■■■□ 3.03
KCNJ4P48050 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
KCNJ4P48050 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC33.97■■■■□ 3.03
KCNJ4P48050 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.97■■■■□ 3.03
KCNJ4P48050 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.03
KCNJ4P48050 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC33.94■■■■□ 3.02
KCNJ4P48050 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC33.94■■■■□ 3.02
KCNJ4P48050 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC33.94■■■■□ 3.02
KCNJ4P48050 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC33.93■■■■□ 3.02
KCNJ4P48050 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC33.93■■■■□ 3.02
KCNJ4P48050 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
KCNJ4P48050 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC33.92■■■■□ 3.02
KCNJ4P48050 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
KCNJ4P48050 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
KCNJ4P48050 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.89■■■■□ 3.02
KCNJ4P48050 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.89■■■■□ 3.02
KCNJ4P48050 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
KCNJ4P48050 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC33.85■■■■□ 3.01
KCNJ4P48050 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
KCNJ4P48050 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC33.84■■■■□ 3.01
KCNJ4P48050 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC33.84■■■■□ 3.01
KCNJ4P48050 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC33.84■■■■□ 3.01
KCNJ4P48050 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3
KCNJ4P48050 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC33.82■■■■□ 3
KCNJ4P48050 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC33.82■■■■□ 3
KCNJ4P48050 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC33.78■■■■□ 3
KCNJ4P48050 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
KCNJ4P48050 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
KCNJ4P48050 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
KCNJ4P48050 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
KCNJ4P48050 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC33.77■■■■□ 3
KCNJ4P48050 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.75■■■□□ 2.99
KCNJ4P48050 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.3 ms