Protein–RNA interactions for Protein: P45452

MMP13, Collagenase 3, humanhuman

Predictions only

Length 471 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MMP13P45452 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
MMP13P45452 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
MMP13P45452 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.22
MMP13P45452 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
MMP13P45452 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
MMP13P45452 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC28.88■■■□□ 2.21
MMP13P45452 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
MMP13P45452 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
MMP13P45452 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
MMP13P45452 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
MMP13P45452 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
MMP13P45452 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
MMP13P45452 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
MMP13P45452 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
MMP13P45452 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
MMP13P45452 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
MMP13P45452 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
MMP13P45452 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
MMP13P45452 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC28.78■■■□□ 2.2
MMP13P45452 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC28.78■■■□□ 2.2
MMP13P45452 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
MMP13P45452 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC28.75■■■□□ 2.19
MMP13P45452 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
MMP13P45452 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
MMP13P45452 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
MMP13P45452 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
MMP13P45452 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
MMP13P45452 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
MMP13P45452 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC28.7■■■□□ 2.18
MMP13P45452 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC28.7■■■□□ 2.18
MMP13P45452 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
MMP13P45452 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
MMP13P45452 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
MMP13P45452 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
MMP13P45452 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
MMP13P45452 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC28.66■■■□□ 2.18
MMP13P45452 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
MMP13P45452 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
MMP13P45452 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.18
MMP13P45452 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
MMP13P45452 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
MMP13P45452 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
MMP13P45452 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
MMP13P45452 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
MMP13P45452 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
MMP13P45452 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
MMP13P45452 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
MMP13P45452 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
MMP13P45452 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
MMP13P45452 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
MMP13P45452 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
MMP13P45452 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
MMP13P45452 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.49■■■□□ 2.15
MMP13P45452 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
MMP13P45452 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
MMP13P45452 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
MMP13P45452 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
MMP13P45452 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
MMP13P45452 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
MMP13P45452 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
MMP13P45452 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
MMP13P45452 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC28.45■■■□□ 2.14
MMP13P45452 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.14
MMP13P45452 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
MMP13P45452 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
MMP13P45452 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
MMP13P45452 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
MMP13P45452 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC28.4■■■□□ 2.14
MMP13P45452 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
MMP13P45452 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC28.37■■■□□ 2.13
MMP13P45452 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
MMP13P45452 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
MMP13P45452 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
MMP13P45452 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC28.34■■■□□ 2.13
MMP13P45452 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
MMP13P45452 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
MMP13P45452 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
MMP13P45452 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC28.33■■■□□ 2.13
MMP13P45452 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
MMP13P45452 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
MMP13P45452 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
MMP13P45452 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
MMP13P45452 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
MMP13P45452 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.27■■■□□ 2.12
MMP13P45452 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
MMP13P45452 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
MMP13P45452 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
MMP13P45452 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
MMP13P45452 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
MMP13P45452 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
MMP13P45452 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
MMP13P45452 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
MMP13P45452 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
MMP13P45452 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC28.24■■■□□ 2.11
MMP13P45452 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
MMP13P45452 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
MMP13P45452 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
MMP13P45452 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
MMP13P45452 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
MMP13P45452 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 8.4 ms