Protein–RNA interactions for Protein: P42166

TMPO, Lamina-associated polypeptide 2, isoform alpha, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 694 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMPOP42166 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC36.68■■■■□ 3.46
TMPOP42166 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC36.66■■■■□ 3.46
TMPOP42166 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC36.65■■■■□ 3.46
TMPOP42166 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC36.64■■■■□ 3.46
TMPOP42166 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.64■■■■□ 3.46
TMPOP42166 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC36.63■■■■□ 3.45
TMPOP42166 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC36.63■■■■□ 3.45
TMPOP42166 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.63■■■■□ 3.45
TMPOP42166 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC36.63■■■■□ 3.45
TMPOP42166 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.6■■■■□ 3.45
TMPOP42166 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC36.6■■■■□ 3.45
TMPOP42166 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC36.6■■■■□ 3.45
TMPOP42166 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.59■■■■□ 3.45
TMPOP42166 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.59■■■■□ 3.45
TMPOP42166 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.57■■■■□ 3.45
TMPOP42166 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC36.57■■■■□ 3.44
TMPOP42166 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.57■■■■□ 3.44
TMPOP42166 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.56■■■■□ 3.44
TMPOP42166 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC36.53■■■■□ 3.44
TMPOP42166 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC36.53■■■■□ 3.44
TMPOP42166 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC36.52■■■■□ 3.44
TMPOP42166 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC36.51■■■■□ 3.44
TMPOP42166 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.51■■■■□ 3.43
TMPOP42166 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.5■■■■□ 3.43
TMPOP42166 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC36.5■■■■□ 3.43
TMPOP42166 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC36.49■■■■□ 3.43
TMPOP42166 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.48■■■■□ 3.43
TMPOP42166 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC36.47■■■■□ 3.43
TMPOP42166 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC36.44■■■■□ 3.42
TMPOP42166 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.42■■■■□ 3.42
TMPOP42166 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.42■■■■□ 3.42
TMPOP42166 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC36.41■■■■□ 3.42
TMPOP42166 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC36.41■■■■□ 3.42
TMPOP42166 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC36.4■■■■□ 3.42
TMPOP42166 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.39■■■■□ 3.42
TMPOP42166 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC36.39■■■■□ 3.42
TMPOP42166 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC36.38■■■■□ 3.42
TMPOP42166 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.38■■■■□ 3.41
TMPOP42166 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC36.38■■■■□ 3.41
TMPOP42166 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC36.37■■■■□ 3.41
TMPOP42166 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC36.37■■■■□ 3.41
TMPOP42166 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC36.37■■■■□ 3.41
TMPOP42166 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC36.36■■■■□ 3.41
TMPOP42166 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC36.36■■■■□ 3.41
TMPOP42166 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.34■■■■□ 3.41
TMPOP42166 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.34■■■■□ 3.41
TMPOP42166 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.33■■■■□ 3.41
TMPOP42166 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC36.33■■■■□ 3.41
TMPOP42166 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC36.33■■■■□ 3.41
TMPOP42166 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.33■■■■□ 3.41
TMPOP42166 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.3■■■■□ 3.4
TMPOP42166 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.3■■■■□ 3.4
TMPOP42166 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.27■■■■□ 3.4
TMPOP42166 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC36.26■■■■□ 3.4
TMPOP42166 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC36.26■■■■□ 3.39
TMPOP42166 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.25■■■■□ 3.39
TMPOP42166 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.24■■■■□ 3.39
TMPOP42166 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.24■■■■□ 3.39
TMPOP42166 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC36.23■■■■□ 3.39
TMPOP42166 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.22■■■■□ 3.39
TMPOP42166 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.21■■■■□ 3.39
TMPOP42166 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC36.2■■■■□ 3.39
TMPOP42166 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC36.18■■■■□ 3.38
TMPOP42166 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC36.18■■■■□ 3.38
TMPOP42166 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC36.17■■■■□ 3.38
TMPOP42166 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC36.17■■■■□ 3.38
TMPOP42166 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.16■■■■□ 3.38
TMPOP42166 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC36.16■■■■□ 3.38
TMPOP42166 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC36.12■■■■□ 3.37
TMPOP42166 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.1■■■■□ 3.37
TMPOP42166 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.1■■■■□ 3.37
TMPOP42166 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC36.1■■■■□ 3.37
TMPOP42166 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.1■■■■□ 3.37
TMPOP42166 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.09■■■■□ 3.37
TMPOP42166 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.08■■■■□ 3.37
TMPOP42166 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC36.07■■■■□ 3.36
TMPOP42166 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC36.04■■■■□ 3.36
TMPOP42166 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC36.02■■■■□ 3.36
TMPOP42166 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.02■■■■□ 3.36
TMPOP42166 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC36.02■■■■□ 3.36
TMPOP42166 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC36.01■■■■□ 3.36
TMPOP42166 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC36■■■■□ 3.35
TMPOP42166 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC35.99■■■■□ 3.35
TMPOP42166 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.98■■■■□ 3.35
TMPOP42166 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC35.97■■■■□ 3.35
TMPOP42166 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC35.97■■■■□ 3.35
TMPOP42166 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC35.96■■■■□ 3.35
TMPOP42166 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC35.96■■■■□ 3.35
TMPOP42166 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC35.95■■■■□ 3.35
TMPOP42166 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.95■■■■□ 3.35
TMPOP42166 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.95■■■■□ 3.35
TMPOP42166 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC35.95■■■■□ 3.35
TMPOP42166 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC35.94■■■■□ 3.34
TMPOP42166 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.93■■■■□ 3.34
TMPOP42166 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.92■■■■□ 3.34
TMPOP42166 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC35.92■■■■□ 3.34
TMPOP42166 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.89■■■■□ 3.34
TMPOP42166 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.89■■■■□ 3.34
TMPOP42166 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.89■■■■□ 3.34
TMPOP42166 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC35.88■■■■□ 3.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.8 ms