Protein–RNA interactions for Protein: P42127

ASIP, Agouti-signaling protein, humanhuman

Predictions only

Length 132 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ASIPP42127 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ASIPP42127 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ASIPP42127 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
ASIPP42127 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ASIPP42127 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
ASIPP42127 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ASIPP42127 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ASIPP42127 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ASIPP42127 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ASIPP42127 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.86
ASIPP42127 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ASIPP42127 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
ASIPP42127 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ASIPP42127 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ASIPP42127 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
ASIPP42127 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ASIPP42127 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
ASIPP42127 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
ASIPP42127 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
ASIPP42127 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ASIPP42127 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
ASIPP42127 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
ASIPP42127 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ASIPP42127 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ASIPP42127 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ASIPP42127 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ASIPP42127 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC20.34■□□□□ 0.85
ASIPP42127 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
ASIPP42127 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
ASIPP42127 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
ASIPP42127 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
ASIPP42127 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
ASIPP42127 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
ASIPP42127 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
ASIPP42127 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
ASIPP42127 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
ASIPP42127 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
ASIPP42127 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC20.27■□□□□ 0.84
ASIPP42127 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
ASIPP42127 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
ASIPP42127 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
ASIPP42127 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ASIPP42127 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
ASIPP42127 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
ASIPP42127 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.83
ASIPP42127 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ASIPP42127 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ASIPP42127 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ASIPP42127 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ASIPP42127 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ASIPP42127 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ASIPP42127 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ASIPP42127 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ASIPP42127 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ASIPP42127 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ASIPP42127 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ASIPP42127 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ASIPP42127 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ASIPP42127 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ASIPP42127 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ASIPP42127 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ASIPP42127 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ASIPP42127 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ASIPP42127 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ASIPP42127 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ASIPP42127 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ASIPP42127 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ASIPP42127 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ASIPP42127 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ASIPP42127 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ASIPP42127 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ASIPP42127 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ASIPP42127 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ASIPP42127 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ASIPP42127 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ASIPP42127 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
ASIPP42127 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ASIPP42127 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ASIPP42127 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ASIPP42127 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ASIPP42127 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ASIPP42127 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
ASIPP42127 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ASIPP42127 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
ASIPP42127 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
ASIPP42127 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
ASIPP42127 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
ASIPP42127 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
ASIPP42127 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
ASIPP42127 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
ASIPP42127 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
ASIPP42127 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
ASIPP42127 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
ASIPP42127 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
ASIPP42127 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
ASIPP42127 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
ASIPP42127 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
ASIPP42127 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
ASIPP42127 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
ASIPP42127 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.5 ms