Protein–RNA interactions for Protein: P40926

MDH2, Malate dehydrogenase, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 338 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MDH2P40926 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
MDH2P40926 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
MDH2P40926 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
MDH2P40926 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
MDH2P40926 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
MDH2P40926 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
MDH2P40926 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
MDH2P40926 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
MDH2P40926 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
MDH2P40926 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
MDH2P40926 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
MDH2P40926 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
MDH2P40926 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
MDH2P40926 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
MDH2P40926 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
MDH2P40926 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
MDH2P40926 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
MDH2P40926 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
MDH2P40926 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
MDH2P40926 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
MDH2P40926 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
MDH2P40926 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
MDH2P40926 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
MDH2P40926 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
MDH2P40926 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
MDH2P40926 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
MDH2P40926 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
MDH2P40926 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
MDH2P40926 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
MDH2P40926 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
MDH2P40926 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
MDH2P40926 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
MDH2P40926 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
MDH2P40926 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
MDH2P40926 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
MDH2P40926 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
MDH2P40926 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
MDH2P40926 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC23.4■■□□□ 1.34
MDH2P40926 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
MDH2P40926 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
MDH2P40926 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
MDH2P40926 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
MDH2P40926 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
MDH2P40926 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
MDH2P40926 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
MDH2P40926 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
MDH2P40926 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
MDH2P40926 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
MDH2P40926 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
MDH2P40926 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
MDH2P40926 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
MDH2P40926 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
MDH2P40926 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
MDH2P40926 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
MDH2P40926 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
MDH2P40926 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
MDH2P40926 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
MDH2P40926 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
MDH2P40926 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
MDH2P40926 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
MDH2P40926 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
MDH2P40926 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
MDH2P40926 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
MDH2P40926 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
MDH2P40926 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
MDH2P40926 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
MDH2P40926 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
MDH2P40926 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
MDH2P40926 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
MDH2P40926 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
MDH2P40926 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
MDH2P40926 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
MDH2P40926 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
MDH2P40926 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
MDH2P40926 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
MDH2P40926 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
MDH2P40926 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
MDH2P40926 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
MDH2P40926 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
MDH2P40926 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
MDH2P40926 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
MDH2P40926 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
MDH2P40926 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
MDH2P40926 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
MDH2P40926 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
MDH2P40926 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
MDH2P40926 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
MDH2P40926 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
MDH2P40926 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
MDH2P40926 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
MDH2P40926 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
MDH2P40926 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
MDH2P40926 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
MDH2P40926 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
MDH2P40926 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
MDH2P40926 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
MDH2P40926 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
MDH2P40926 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
MDH2P40926 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
MDH2P40926 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.6 ms