Protein–RNA interactions for Protein: P35527

KRT9, Keratin, type I cytoskeletal 9, humanhuman

Predictions only

Length 623 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT9P35527 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
KRT9P35527 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
KRT9P35527 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
KRT9P35527 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC30.38■■■□□ 2.45
KRT9P35527 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
KRT9P35527 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
KRT9P35527 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
KRT9P35527 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
KRT9P35527 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.34■■■□□ 2.45
KRT9P35527 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC30.28■■■□□ 2.44
KRT9P35527 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC30.27■■■□□ 2.44
KRT9P35527 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC30.25■■■□□ 2.43
KRT9P35527 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
KRT9P35527 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
KRT9P35527 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC30.22■■■□□ 2.43
KRT9P35527 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC30.22■■■□□ 2.43
KRT9P35527 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.22■■■□□ 2.43
KRT9P35527 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
KRT9P35527 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
KRT9P35527 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.42
KRT9P35527 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
KRT9P35527 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC30.19■■■□□ 2.42
KRT9P35527 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC30.18■■■□□ 2.42
KRT9P35527 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
KRT9P35527 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
KRT9P35527 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC30.17■■■□□ 2.42
KRT9P35527 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
KRT9P35527 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC30.16■■■□□ 2.42
KRT9P35527 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.15■■■□□ 2.42
KRT9P35527 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
KRT9P35527 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC30.14■■■□□ 2.42
KRT9P35527 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
KRT9P35527 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC30.12■■■□□ 2.41
KRT9P35527 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC30.12■■■□□ 2.41
KRT9P35527 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC30.12■■■□□ 2.41
KRT9P35527 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
KRT9P35527 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
KRT9P35527 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC30.09■■■□□ 2.41
KRT9P35527 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
KRT9P35527 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC30.08■■■□□ 2.41
KRT9P35527 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
KRT9P35527 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
KRT9P35527 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
KRT9P35527 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
KRT9P35527 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC30.02■■■□□ 2.4
KRT9P35527 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC30.02■■■□□ 2.4
KRT9P35527 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
KRT9P35527 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30■■■□□ 2.39
KRT9P35527 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
KRT9P35527 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
KRT9P35527 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
KRT9P35527 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC29.98■■■□□ 2.39
KRT9P35527 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC29.97■■■□□ 2.39
KRT9P35527 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
KRT9P35527 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
KRT9P35527 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC29.96■■■□□ 2.39
KRT9P35527 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
KRT9P35527 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC29.95■■■□□ 2.39
KRT9P35527 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
KRT9P35527 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
KRT9P35527 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
KRT9P35527 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
KRT9P35527 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC29.93■■■□□ 2.38
KRT9P35527 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
KRT9P35527 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
KRT9P35527 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.91■■■□□ 2.38
KRT9P35527 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.91■■■□□ 2.38
KRT9P35527 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.9■■■□□ 2.38
KRT9P35527 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
KRT9P35527 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC29.89■■■□□ 2.38
KRT9P35527 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
KRT9P35527 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC29.87■■■□□ 2.37
KRT9P35527 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC29.87■■■□□ 2.37
KRT9P35527 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
KRT9P35527 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.86■■■□□ 2.37
KRT9P35527 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC29.86■■■□□ 2.37
KRT9P35527 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
KRT9P35527 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
KRT9P35527 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC29.83■■■□□ 2.37
KRT9P35527 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
KRT9P35527 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
KRT9P35527 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
KRT9P35527 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
KRT9P35527 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
KRT9P35527 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
KRT9P35527 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
KRT9P35527 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
KRT9P35527 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC29.78■■■□□ 2.36
KRT9P35527 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC29.77■■■□□ 2.36
KRT9P35527 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC29.77■■■□□ 2.36
KRT9P35527 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
KRT9P35527 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.36
KRT9P35527 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
KRT9P35527 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
KRT9P35527 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
KRT9P35527 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC29.7■■■□□ 2.35
KRT9P35527 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
KRT9P35527 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
KRT9P35527 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC29.68■■■□□ 2.34
KRT9P35527 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC29.68■■■□□ 2.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.6 ms