Protein–RNA interactions for Protein: P25942

CD40, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 5, humanhuman

Predictions only

Length 277 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD40P25942 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CD40P25942 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CD40P25942 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CD40P25942 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CD40P25942 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CD40P25942 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CD40P25942 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CD40P25942 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CD40P25942 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CD40P25942 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CD40P25942 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CD40P25942 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CD40P25942 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CD40P25942 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CD40P25942 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CD40P25942 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CD40P25942 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CD40P25942 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CD40P25942 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
CD40P25942 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CD40P25942 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CD40P25942 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CD40P25942 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
CD40P25942 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CD40P25942 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CD40P25942 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
CD40P25942 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CD40P25942 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CD40P25942 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CD40P25942 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CD40P25942 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CD40P25942 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CD40P25942 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
CD40P25942 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CD40P25942 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CD40P25942 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CD40P25942 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CD40P25942 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CD40P25942 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC23.89■■□□□ 1.42
CD40P25942 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
CD40P25942 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CD40P25942 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CD40P25942 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CD40P25942 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CD40P25942 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CD40P25942 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CD40P25942 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CD40P25942 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CD40P25942 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CD40P25942 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CD40P25942 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CD40P25942 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
CD40P25942 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CD40P25942 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CD40P25942 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
CD40P25942 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
CD40P25942 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CD40P25942 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CD40P25942 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
CD40P25942 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CD40P25942 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CD40P25942 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
CD40P25942 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CD40P25942 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CD40P25942 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CD40P25942 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CD40P25942 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CD40P25942 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CD40P25942 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CD40P25942 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CD40P25942 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.39
CD40P25942 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CD40P25942 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CD40P25942 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CD40P25942 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CD40P25942 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CD40P25942 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CD40P25942 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CD40P25942 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CD40P25942 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CD40P25942 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CD40P25942 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CD40P25942 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CD40P25942 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
CD40P25942 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CD40P25942 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
CD40P25942 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CD40P25942 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CD40P25942 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CD40P25942 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CD40P25942 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
CD40P25942 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
CD40P25942 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CD40P25942 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CD40P25942 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CD40P25942 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CD40P25942 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CD40P25942 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CD40P25942 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
CD40P25942 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.8 ms