Protein–RNA interactions for Protein: P23760

PAX3, Paired box protein Pax-3, humanhuman

Predictions only

Length 479 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PAX3P23760 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
PAX3P23760 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC29.83■■■□□ 2.37
PAX3P23760 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
PAX3P23760 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
PAX3P23760 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
PAX3P23760 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC29.77■■■□□ 2.36
PAX3P23760 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
PAX3P23760 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
PAX3P23760 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC29.77■■■□□ 2.36
PAX3P23760 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.36
PAX3P23760 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
PAX3P23760 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC29.74■■■□□ 2.35
PAX3P23760 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC29.74■■■□□ 2.35
PAX3P23760 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC29.73■■■□□ 2.35
PAX3P23760 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC29.72■■■□□ 2.35
PAX3P23760 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC29.72■■■□□ 2.35
PAX3P23760 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
PAX3P23760 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC29.7■■■□□ 2.34
PAX3P23760 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC29.69■■■□□ 2.34
PAX3P23760 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
PAX3P23760 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
PAX3P23760 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC29.65■■■□□ 2.34
PAX3P23760 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.65■■■□□ 2.34
PAX3P23760 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
PAX3P23760 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
PAX3P23760 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
PAX3P23760 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
PAX3P23760 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC29.61■■■□□ 2.33
PAX3P23760 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC29.6■■■□□ 2.33
PAX3P23760 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC29.6■■■□□ 2.33
PAX3P23760 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC29.59■■■□□ 2.33
PAX3P23760 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
PAX3P23760 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
PAX3P23760 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.56■■■□□ 2.32
PAX3P23760 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC29.56■■■□□ 2.32
PAX3P23760 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC29.54■■■□□ 2.32
PAX3P23760 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
PAX3P23760 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
PAX3P23760 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC29.53■■■□□ 2.32
PAX3P23760 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC29.53■■■□□ 2.32
PAX3P23760 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC29.52■■■□□ 2.32
PAX3P23760 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC29.51■■■□□ 2.32
PAX3P23760 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
PAX3P23760 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
PAX3P23760 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
PAX3P23760 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
PAX3P23760 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.48■■■□□ 2.31
PAX3P23760 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.47■■■□□ 2.31
PAX3P23760 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC29.46■■■□□ 2.31
PAX3P23760 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
PAX3P23760 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
PAX3P23760 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
PAX3P23760 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC29.42■■■□□ 2.3
PAX3P23760 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC29.42■■■□□ 2.3
PAX3P23760 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC29.4■■■□□ 2.3
PAX3P23760 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC29.4■■■□□ 2.3
PAX3P23760 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
PAX3P23760 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
PAX3P23760 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
PAX3P23760 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
PAX3P23760 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.29
PAX3P23760 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
PAX3P23760 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
PAX3P23760 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
PAX3P23760 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.37■■■□□ 2.29
PAX3P23760 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
PAX3P23760 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC29.36■■■□□ 2.29
PAX3P23760 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
PAX3P23760 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
PAX3P23760 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
PAX3P23760 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
PAX3P23760 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
PAX3P23760 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.32■■■□□ 2.28
PAX3P23760 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC29.32■■■□□ 2.28
PAX3P23760 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
PAX3P23760 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC29.31■■■□□ 2.28
PAX3P23760 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
PAX3P23760 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
PAX3P23760 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
PAX3P23760 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
PAX3P23760 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC29.27■■■□□ 2.28
PAX3P23760 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC29.27■■■□□ 2.28
PAX3P23760 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
PAX3P23760 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC29.23■■■□□ 2.27
PAX3P23760 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
PAX3P23760 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
PAX3P23760 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
PAX3P23760 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
PAX3P23760 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
PAX3P23760 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
PAX3P23760 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC29.18■■■□□ 2.26
PAX3P23760 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
PAX3P23760 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
PAX3P23760 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.16■■■□□ 2.26
PAX3P23760 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
PAX3P23760 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC29.14■■■□□ 2.26
PAX3P23760 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
PAX3P23760 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
PAX3P23760 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
PAX3P23760 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.3 ms