Protein–RNA interactions for Protein: P17612

PRKACA, cAMP-dependent protein kinase catalytic subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 351 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKACAP17612 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PRKACAP17612 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PRKACAP17612 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
PRKACAP17612 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PRKACAP17612 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PRKACAP17612 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PRKACAP17612 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PRKACAP17612 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PRKACAP17612 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PRKACAP17612 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PRKACAP17612 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PRKACAP17612 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PRKACAP17612 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
PRKACAP17612 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
PRKACAP17612 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
PRKACAP17612 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
PRKACAP17612 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PRKACAP17612 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PRKACAP17612 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PRKACAP17612 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PRKACAP17612 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PRKACAP17612 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PRKACAP17612 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PRKACAP17612 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PRKACAP17612 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
PRKACAP17612 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PRKACAP17612 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PRKACAP17612 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PRKACAP17612 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PRKACAP17612 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PRKACAP17612 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PRKACAP17612 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PRKACAP17612 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PRKACAP17612 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PRKACAP17612 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PRKACAP17612 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PRKACAP17612 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.35
PRKACAP17612 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PRKACAP17612 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PRKACAP17612 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
PRKACAP17612 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PRKACAP17612 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PRKACAP17612 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PRKACAP17612 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PRKACAP17612 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PRKACAP17612 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PRKACAP17612 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PRKACAP17612 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PRKACAP17612 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PRKACAP17612 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PRKACAP17612 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PRKACAP17612 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PRKACAP17612 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PRKACAP17612 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PRKACAP17612 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PRKACAP17612 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
PRKACAP17612 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PRKACAP17612 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PRKACAP17612 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PRKACAP17612 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PRKACAP17612 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PRKACAP17612 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PRKACAP17612 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PRKACAP17612 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PRKACAP17612 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PRKACAP17612 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
PRKACAP17612 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
PRKACAP17612 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PRKACAP17612 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PRKACAP17612 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
PRKACAP17612 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
PRKACAP17612 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PRKACAP17612 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PRKACAP17612 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PRKACAP17612 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PRKACAP17612 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PRKACAP17612 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PRKACAP17612 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PRKACAP17612 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PRKACAP17612 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PRKACAP17612 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
PRKACAP17612 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PRKACAP17612 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PRKACAP17612 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PRKACAP17612 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
PRKACAP17612 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PRKACAP17612 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PRKACAP17612 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PRKACAP17612 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PRKACAP17612 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PRKACAP17612 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PRKACAP17612 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
PRKACAP17612 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PRKACAP17612 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PRKACAP17612 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PRKACAP17612 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PRKACAP17612 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PRKACAP17612 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PRKACAP17612 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PRKACAP17612 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.1 ms