Protein–RNA interactions for Protein: P15976

GATA1, Erythroid transcription factor, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 413 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GATA1P15976 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
GATA1P15976 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
GATA1P15976 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
GATA1P15976 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
GATA1P15976 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
GATA1P15976 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
GATA1P15976 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
GATA1P15976 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
GATA1P15976 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
GATA1P15976 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
GATA1P15976 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
GATA1P15976 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
GATA1P15976 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
GATA1P15976 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
GATA1P15976 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
GATA1P15976 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
GATA1P15976 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
GATA1P15976 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
GATA1P15976 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
GATA1P15976 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
GATA1P15976 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
GATA1P15976 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
GATA1P15976 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
GATA1P15976 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
GATA1P15976 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
GATA1P15976 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
GATA1P15976 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
GATA1P15976 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
GATA1P15976 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
GATA1P15976 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
GATA1P15976 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
GATA1P15976 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
GATA1P15976 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
GATA1P15976 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
GATA1P15976 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
GATA1P15976 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
GATA1P15976 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
GATA1P15976 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
GATA1P15976 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
GATA1P15976 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
GATA1P15976 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
GATA1P15976 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
GATA1P15976 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
GATA1P15976 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
GATA1P15976 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
GATA1P15976 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
GATA1P15976 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
GATA1P15976 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
GATA1P15976 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
GATA1P15976 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
GATA1P15976 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
GATA1P15976 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
GATA1P15976 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
GATA1P15976 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
GATA1P15976 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
GATA1P15976 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
GATA1P15976 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
GATA1P15976 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
GATA1P15976 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
GATA1P15976 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
GATA1P15976 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
GATA1P15976 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
GATA1P15976 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
GATA1P15976 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
GATA1P15976 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
GATA1P15976 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
GATA1P15976 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
GATA1P15976 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
GATA1P15976 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
GATA1P15976 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
GATA1P15976 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
GATA1P15976 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
GATA1P15976 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
GATA1P15976 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
GATA1P15976 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
GATA1P15976 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
GATA1P15976 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
GATA1P15976 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
GATA1P15976 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
GATA1P15976 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
GATA1P15976 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
GATA1P15976 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
GATA1P15976 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
GATA1P15976 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
GATA1P15976 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
GATA1P15976 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC19.88■□□□□ 0.77
GATA1P15976 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
GATA1P15976 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
GATA1P15976 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC19.87■□□□□ 0.77
GATA1P15976 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
GATA1P15976 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
GATA1P15976 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
GATA1P15976 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
GATA1P15976 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
GATA1P15976 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
GATA1P15976 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC19.85■□□□□ 0.77
GATA1P15976 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
GATA1P15976 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
GATA1P15976 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
GATA1P15976 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.1 ms