Protein–RNA interactions for Protein: P11532

DMD, Dystrophin, humanhuman

Predictions only

Length 3,685 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DMDP11532 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
DMDP11532 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
DMDP11532 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
DMDP11532 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC28.54■■■□□ 2.16
DMDP11532 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
DMDP11532 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC28.51■■■□□ 2.15
DMDP11532 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
DMDP11532 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC28.5■■■□□ 2.15
DMDP11532 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
DMDP11532 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC28.47■■■□□ 2.15
DMDP11532 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
DMDP11532 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.15
DMDP11532 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC28.45■■■□□ 2.14
DMDP11532 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
DMDP11532 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
DMDP11532 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
DMDP11532 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
DMDP11532 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
DMDP11532 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC28.41■■■□□ 2.14
DMDP11532 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
DMDP11532 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
DMDP11532 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
DMDP11532 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
DMDP11532 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
DMDP11532 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC28.36■■■□□ 2.13
DMDP11532 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
DMDP11532 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
DMDP11532 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
DMDP11532 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.32■■■□□ 2.12
DMDP11532 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
DMDP11532 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
DMDP11532 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC28.31■■■□□ 2.12
DMDP11532 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
DMDP11532 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
DMDP11532 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
DMDP11532 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
DMDP11532 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.12
DMDP11532 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
DMDP11532 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
DMDP11532 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC28.24■■■□□ 2.11
DMDP11532 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
DMDP11532 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
DMDP11532 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
DMDP11532 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
DMDP11532 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC28.22■■■□□ 2.11
DMDP11532 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
DMDP11532 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
DMDP11532 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC28.21■■■□□ 2.11
DMDP11532 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC28.21■■■□□ 2.11
DMDP11532 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
DMDP11532 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
DMDP11532 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC28.16■■■□□ 2.1
DMDP11532 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
DMDP11532 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
DMDP11532 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
DMDP11532 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
DMDP11532 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC28.11■■■□□ 2.09
DMDP11532 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
DMDP11532 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
DMDP11532 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
DMDP11532 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
DMDP11532 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
DMDP11532 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
DMDP11532 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC28.04■■■□□ 2.08
DMDP11532 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
DMDP11532 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
DMDP11532 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
DMDP11532 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
DMDP11532 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
DMDP11532 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
DMDP11532 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
DMDP11532 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
DMDP11532 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
DMDP11532 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
DMDP11532 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
DMDP11532 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
DMDP11532 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
DMDP11532 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
DMDP11532 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
DMDP11532 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
DMDP11532 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
DMDP11532 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
DMDP11532 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
DMDP11532 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
DMDP11532 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
DMDP11532 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
DMDP11532 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
DMDP11532 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
DMDP11532 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
DMDP11532 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
DMDP11532 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
DMDP11532 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC27.82■■■□□ 2.04
DMDP11532 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
DMDP11532 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
DMDP11532 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC27.81■■■□□ 2.04
DMDP11532 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
DMDP11532 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
DMDP11532 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
DMDP11532 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
DMDP11532 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC27.78■■■□□ 2.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 165.4 ms