Protein–RNA interactions for Protein: P11055

MYH3, Myosin-3, humanhuman

Predictions only

Length 1,940 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MYH3P11055 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC35.02■■■■□ 3.2
MYH3P11055 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35■■■■□ 3.19
MYH3P11055 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC34.96■■■■□ 3.19
MYH3P11055 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.96■■■■□ 3.19
MYH3P11055 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC34.96■■■■□ 3.19
MYH3P11055 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC34.95■■■■□ 3.19
MYH3P11055 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.91■■■■□ 3.18
MYH3P11055 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC34.9■■■■□ 3.18
MYH3P11055 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.9■■■■□ 3.18
MYH3P11055 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.9■■■■□ 3.18
MYH3P11055 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC34.89■■■■□ 3.18
MYH3P11055 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC34.87■■■■□ 3.17
MYH3P11055 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.85■■■■□ 3.17
MYH3P11055 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.82■■■■□ 3.17
MYH3P11055 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.82■■■■□ 3.16
MYH3P11055 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.82■■■■□ 3.16
MYH3P11055 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.79■■■■□ 3.16
MYH3P11055 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC34.79■■■■□ 3.16
MYH3P11055 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.78■■■■□ 3.16
MYH3P11055 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC34.77■■■■□ 3.16
MYH3P11055 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC34.76■■■■□ 3.16
MYH3P11055 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.76■■■■□ 3.15
MYH3P11055 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.75■■■■□ 3.15
MYH3P11055 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.73■■■■□ 3.15
MYH3P11055 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.7■■■■□ 3.15
MYH3P11055 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC34.7■■■■□ 3.15
MYH3P11055 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC34.68■■■■□ 3.14
MYH3P11055 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.68■■■■□ 3.14
MYH3P11055 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC34.65■■■■□ 3.14
MYH3P11055 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC34.64■■■■□ 3.14
MYH3P11055 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.64■■■■□ 3.14
MYH3P11055 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC34.63■■■■□ 3.13
MYH3P11055 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC34.62■■■■□ 3.13
MYH3P11055 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.61■■■■□ 3.13
MYH3P11055 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC34.59■■■■□ 3.13
MYH3P11055 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC34.59■■■■□ 3.13
MYH3P11055 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.59■■■■□ 3.13
MYH3P11055 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.57■■■■□ 3.12
MYH3P11055 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC34.55■■■■□ 3.12
MYH3P11055 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.53■■■■□ 3.12
MYH3P11055 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.53■■■■□ 3.12
MYH3P11055 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC34.52■■■■□ 3.12
MYH3P11055 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC34.51■■■■□ 3.12
MYH3P11055 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC34.51■■■■□ 3.12
MYH3P11055 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.51■■■■□ 3.11
MYH3P11055 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.5■■■■□ 3.11
MYH3P11055 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC34.49■■■■□ 3.11
MYH3P11055 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.49■■■■□ 3.11
MYH3P11055 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC34.49■■■■□ 3.11
MYH3P11055 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.49■■■■□ 3.11
MYH3P11055 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC34.49■■■■□ 3.11
MYH3P11055 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC34.45■■■■□ 3.11
MYH3P11055 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC34.45■■■■□ 3.11
MYH3P11055 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.43■■■■□ 3.1
MYH3P11055 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC34.41■■■■□ 3.1
MYH3P11055 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC34.4■■■■□ 3.1
MYH3P11055 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.4■■■■□ 3.1
MYH3P11055 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.36■■■■□ 3.09
MYH3P11055 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC34.34■■■■□ 3.09
MYH3P11055 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC34.33■■■■□ 3.09
MYH3P11055 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC34.33■■■■□ 3.09
MYH3P11055 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC34.33■■■■□ 3.09
MYH3P11055 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC34.32■■■■□ 3.08
MYH3P11055 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC34.31■■■■□ 3.08
MYH3P11055 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC34.29■■■■□ 3.08
MYH3P11055 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.27■■■■□ 3.08
MYH3P11055 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC34.26■■■■□ 3.07
MYH3P11055 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC34.25■■■■□ 3.07
MYH3P11055 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.24■■■■□ 3.07
MYH3P11055 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC34.24■■■■□ 3.07
MYH3P11055 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC34.24■■■■□ 3.07
MYH3P11055 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.2■■■■□ 3.07
MYH3P11055 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC34.2■■■■□ 3.06
MYH3P11055 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC34.18■■■■□ 3.06
MYH3P11055 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC34.17■■■■□ 3.06
MYH3P11055 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC34.17■■■■□ 3.06
MYH3P11055 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.16■■■■□ 3.06
MYH3P11055 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC34.16■■■■□ 3.06
MYH3P11055 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.15■■■■□ 3.06
MYH3P11055 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC34.14■■■■□ 3.06
MYH3P11055 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.14■■■■□ 3.06
MYH3P11055 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC34.14■■■■□ 3.06
MYH3P11055 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC34.13■■■■□ 3.05
MYH3P11055 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.13■■■■□ 3.05
MYH3P11055 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC34.13■■■■□ 3.05
MYH3P11055 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC34.12■■■■□ 3.05
MYH3P11055 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC34.12■■■■□ 3.05
MYH3P11055 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.12■■■■□ 3.05
MYH3P11055 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.11■■■■□ 3.05
MYH3P11055 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC34.11■■■■□ 3.05
MYH3P11055 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC34.09■■■■□ 3.05
MYH3P11055 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.09■■■■□ 3.05
MYH3P11055 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.08■■■■□ 3.05
MYH3P11055 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.08■■■■□ 3.05
MYH3P11055 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC34.07■■■■□ 3.04
MYH3P11055 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC34.06■■■■□ 3.04
MYH3P11055 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC34.06■■■■□ 3.04
MYH3P11055 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC34.06■■■■□ 3.04
MYH3P11055 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.06■■■■□ 3.04
MYH3P11055 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.06■■■■□ 3.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53 ms