Protein–RNA interactions for Protein: P0DL12

SMIM17, Small integral membrane protein 17, humanhuman

Predictions only

Length 118 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM17P0DL12 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SMIM17P0DL12 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SMIM17P0DL12 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SMIM17P0DL12 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SMIM17P0DL12 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SMIM17P0DL12 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SMIM17P0DL12 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SMIM17P0DL12 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SMIM17P0DL12 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SMIM17P0DL12 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SMIM17P0DL12 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SMIM17P0DL12 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SMIM17P0DL12 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
SMIM17P0DL12 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
SMIM17P0DL12 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
SMIM17P0DL12 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SMIM17P0DL12 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SMIM17P0DL12 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SMIM17P0DL12 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
SMIM17P0DL12 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
SMIM17P0DL12 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
SMIM17P0DL12 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SMIM17P0DL12 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SMIM17P0DL12 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SMIM17P0DL12 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SMIM17P0DL12 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SMIM17P0DL12 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SMIM17P0DL12 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SMIM17P0DL12 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SMIM17P0DL12 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SMIM17P0DL12 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
SMIM17P0DL12 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SMIM17P0DL12 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SMIM17P0DL12 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SMIM17P0DL12 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SMIM17P0DL12 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SMIM17P0DL12 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SMIM17P0DL12 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SMIM17P0DL12 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
SMIM17P0DL12 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
SMIM17P0DL12 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
SMIM17P0DL12 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SMIM17P0DL12 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SMIM17P0DL12 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
SMIM17P0DL12 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC20.26■□□□□ 0.83
SMIM17P0DL12 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SMIM17P0DL12 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SMIM17P0DL12 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
SMIM17P0DL12 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
SMIM17P0DL12 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SMIM17P0DL12 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SMIM17P0DL12 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SMIM17P0DL12 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SMIM17P0DL12 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SMIM17P0DL12 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SMIM17P0DL12 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SMIM17P0DL12 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SMIM17P0DL12 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SMIM17P0DL12 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SMIM17P0DL12 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SMIM17P0DL12 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SMIM17P0DL12 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SMIM17P0DL12 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SMIM17P0DL12 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SMIM17P0DL12 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SMIM17P0DL12 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SMIM17P0DL12 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SMIM17P0DL12 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SMIM17P0DL12 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SMIM17P0DL12 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SMIM17P0DL12 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SMIM17P0DL12 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SMIM17P0DL12 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SMIM17P0DL12 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SMIM17P0DL12 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SMIM17P0DL12 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SMIM17P0DL12 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SMIM17P0DL12 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SMIM17P0DL12 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SMIM17P0DL12 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SMIM17P0DL12 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
SMIM17P0DL12 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
SMIM17P0DL12 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SMIM17P0DL12 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
SMIM17P0DL12 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SMIM17P0DL12 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SMIM17P0DL12 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SMIM17P0DL12 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SMIM17P0DL12 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SMIM17P0DL12 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SMIM17P0DL12 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SMIM17P0DL12 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
SMIM17P0DL12 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
SMIM17P0DL12 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
SMIM17P0DL12 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
SMIM17P0DL12 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
SMIM17P0DL12 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
SMIM17P0DL12 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SMIM17P0DL12 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SMIM17P0DL12 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17 ms