Protein–RNA interactions for Protein: P0C5Z0

H2AFB2, Histone H2A-Bbd type 2/3, humanhuman

Predictions only

Length 115 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2AFB2P0C5Z0 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
H2AFB2P0C5Z0 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
H2AFB2P0C5Z0 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
H2AFB2P0C5Z0 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
H2AFB2P0C5Z0 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
H2AFB2P0C5Z0 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
H2AFB2P0C5Z0 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
H2AFB2P0C5Z0 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
H2AFB2P0C5Z0 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
H2AFB2P0C5Z0 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
H2AFB2P0C5Z0 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
H2AFB2P0C5Z0 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
H2AFB2P0C5Z0 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
H2AFB2P0C5Z0 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
H2AFB2P0C5Z0 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
H2AFB2P0C5Z0 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
H2AFB2P0C5Z0 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
H2AFB2P0C5Z0 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
H2AFB2P0C5Z0 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
H2AFB2P0C5Z0 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
H2AFB2P0C5Z0 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
H2AFB2P0C5Z0 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
H2AFB2P0C5Z0 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
H2AFB2P0C5Z0 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
H2AFB2P0C5Z0 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
H2AFB2P0C5Z0 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
H2AFB2P0C5Z0 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
H2AFB2P0C5Z0 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
H2AFB2P0C5Z0 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
H2AFB2P0C5Z0 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC23.69■■□□□ 1.38
H2AFB2P0C5Z0 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
H2AFB2P0C5Z0 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
H2AFB2P0C5Z0 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
H2AFB2P0C5Z0 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
H2AFB2P0C5Z0 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
H2AFB2P0C5Z0 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
H2AFB2P0C5Z0 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
H2AFB2P0C5Z0 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
H2AFB2P0C5Z0 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
H2AFB2P0C5Z0 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
H2AFB2P0C5Z0 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
H2AFB2P0C5Z0 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
H2AFB2P0C5Z0 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
H2AFB2P0C5Z0 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
H2AFB2P0C5Z0 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
H2AFB2P0C5Z0 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
H2AFB2P0C5Z0 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
H2AFB2P0C5Z0 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
H2AFB2P0C5Z0 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC23.58■■□□□ 1.37
H2AFB2P0C5Z0 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
H2AFB2P0C5Z0 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
H2AFB2P0C5Z0 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
H2AFB2P0C5Z0 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
H2AFB2P0C5Z0 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
H2AFB2P0C5Z0 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
H2AFB2P0C5Z0 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
H2AFB2P0C5Z0 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
H2AFB2P0C5Z0 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
H2AFB2P0C5Z0 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
H2AFB2P0C5Z0 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
H2AFB2P0C5Z0 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
H2AFB2P0C5Z0 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
H2AFB2P0C5Z0 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
H2AFB2P0C5Z0 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
H2AFB2P0C5Z0 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
H2AFB2P0C5Z0 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
H2AFB2P0C5Z0 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
H2AFB2P0C5Z0 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
H2AFB2P0C5Z0 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
H2AFB2P0C5Z0 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
H2AFB2P0C5Z0 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
H2AFB2P0C5Z0 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
H2AFB2P0C5Z0 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
H2AFB2P0C5Z0 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
H2AFB2P0C5Z0 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
H2AFB2P0C5Z0 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
H2AFB2P0C5Z0 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
H2AFB2P0C5Z0 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
H2AFB2P0C5Z0 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
H2AFB2P0C5Z0 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
H2AFB2P0C5Z0 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
H2AFB2P0C5Z0 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
H2AFB2P0C5Z0 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
H2AFB2P0C5Z0 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
H2AFB2P0C5Z0 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
H2AFB2P0C5Z0 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
H2AFB2P0C5Z0 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
H2AFB2P0C5Z0 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
H2AFB2P0C5Z0 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
H2AFB2P0C5Z0 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
H2AFB2P0C5Z0 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
H2AFB2P0C5Z0 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
H2AFB2P0C5Z0 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
H2AFB2P0C5Z0 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
H2AFB2P0C5Z0 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
H2AFB2P0C5Z0 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
H2AFB2P0C5Z0 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
H2AFB2P0C5Z0 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
H2AFB2P0C5Z0 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
H2AFB2P0C5Z0 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 103.9 ms