Protein–RNA interactions for Protein: P0C2S0

CTXN2, Cortexin-2, humanhuman

Predictions only

Length 81 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTXN2P0C2S0 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CTXN2P0C2S0 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CTXN2P0C2S0 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CTXN2P0C2S0 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CTXN2P0C2S0 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CTXN2P0C2S0 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CTXN2P0C2S0 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CTXN2P0C2S0 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CTXN2P0C2S0 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CTXN2P0C2S0 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CTXN2P0C2S0 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CTXN2P0C2S0 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CTXN2P0C2S0 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CTXN2P0C2S0 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CTXN2P0C2S0 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CTXN2P0C2S0 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CTXN2P0C2S0 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CTXN2P0C2S0 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CTXN2P0C2S0 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CTXN2P0C2S0 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CTXN2P0C2S0 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CTXN2P0C2S0 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CTXN2P0C2S0 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CTXN2P0C2S0 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CTXN2P0C2S0 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CTXN2P0C2S0 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CTXN2P0C2S0 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
CTXN2P0C2S0 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
CTXN2P0C2S0 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CTXN2P0C2S0 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CTXN2P0C2S0 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
CTXN2P0C2S0 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CTXN2P0C2S0 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CTXN2P0C2S0 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
CTXN2P0C2S0 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CTXN2P0C2S0 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CTXN2P0C2S0 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CTXN2P0C2S0 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CTXN2P0C2S0 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CTXN2P0C2S0 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CTXN2P0C2S0 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CTXN2P0C2S0 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CTXN2P0C2S0 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CTXN2P0C2S0 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CTXN2P0C2S0 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CTXN2P0C2S0 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CTXN2P0C2S0 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CTXN2P0C2S0 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CTXN2P0C2S0 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CTXN2P0C2S0 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CTXN2P0C2S0 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CTXN2P0C2S0 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CTXN2P0C2S0 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CTXN2P0C2S0 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CTXN2P0C2S0 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CTXN2P0C2S0 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CTXN2P0C2S0 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CTXN2P0C2S0 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CTXN2P0C2S0 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CTXN2P0C2S0 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
CTXN2P0C2S0 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CTXN2P0C2S0 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CTXN2P0C2S0 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CTXN2P0C2S0 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CTXN2P0C2S0 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CTXN2P0C2S0 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CTXN2P0C2S0 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CTXN2P0C2S0 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CTXN2P0C2S0 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CTXN2P0C2S0 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CTXN2P0C2S0 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CTXN2P0C2S0 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CTXN2P0C2S0 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CTXN2P0C2S0 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CTXN2P0C2S0 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CTXN2P0C2S0 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CTXN2P0C2S0 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CTXN2P0C2S0 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CTXN2P0C2S0 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CTXN2P0C2S0 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CTXN2P0C2S0 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CTXN2P0C2S0 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CTXN2P0C2S0 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CTXN2P0C2S0 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
CTXN2P0C2S0 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CTXN2P0C2S0 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CTXN2P0C2S0 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CTXN2P0C2S0 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CTXN2P0C2S0 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CTXN2P0C2S0 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CTXN2P0C2S0 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CTXN2P0C2S0 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CTXN2P0C2S0 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
CTXN2P0C2S0 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CTXN2P0C2S0 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CTXN2P0C2S0 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CTXN2P0C2S0 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CTXN2P0C2S0 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CTXN2P0C2S0 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CTXN2P0C2S0 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.3 ms