Protein–RNA interactions for Protein: P08579

SNRPB2, U2 small nuclear ribonucleoprotein B'', humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 225 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNRPB2P08579 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC26.89■■□□□ 1.9
SNRPB2P08579 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
SNRPB2P08579 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.89
SNRPB2P08579 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
SNRPB2P08579 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
SNRPB2P08579 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
SNRPB2P08579 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
SNRPB2P08579 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
SNRPB2P08579 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
SNRPB2P08579 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
SNRPB2P08579 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
SNRPB2P08579 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
SNRPB2P08579 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
SNRPB2P08579 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
SNRPB2P08579 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
SNRPB2P08579 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
SNRPB2P08579 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
SNRPB2P08579 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
SNRPB2P08579 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
SNRPB2P08579 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
SNRPB2P08579 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
SNRPB2P08579 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
SNRPB2P08579 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
SNRPB2P08579 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
SNRPB2P08579 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
SNRPB2P08579 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
SNRPB2P08579 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
SNRPB2P08579 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
SNRPB2P08579 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
SNRPB2P08579 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
SNRPB2P08579 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
SNRPB2P08579 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
SNRPB2P08579 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
SNRPB2P08579 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC26.64■■□□□ 1.85
SNRPB2P08579 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
SNRPB2P08579 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
SNRPB2P08579 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC26.61■■□□□ 1.85
SNRPB2P08579 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
SNRPB2P08579 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
SNRPB2P08579 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
SNRPB2P08579 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
SNRPB2P08579 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC26.58■■□□□ 1.85
SNRPB2P08579 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
SNRPB2P08579 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
SNRPB2P08579 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC26.57■■□□□ 1.84
SNRPB2P08579 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
SNRPB2P08579 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
SNRPB2P08579 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
SNRPB2P08579 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC26.53■■□□□ 1.84
SNRPB2P08579 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
SNRPB2P08579 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
SNRPB2P08579 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
SNRPB2P08579 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
SNRPB2P08579 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
SNRPB2P08579 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
SNRPB2P08579 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC26.51■■□□□ 1.84
SNRPB2P08579 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
SNRPB2P08579 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.5■■□□□ 1.83
SNRPB2P08579 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC26.5■■□□□ 1.83
SNRPB2P08579 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
SNRPB2P08579 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
SNRPB2P08579 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
SNRPB2P08579 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
SNRPB2P08579 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
SNRPB2P08579 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
SNRPB2P08579 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
SNRPB2P08579 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
SNRPB2P08579 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.83
SNRPB2P08579 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
SNRPB2P08579 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
SNRPB2P08579 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
SNRPB2P08579 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
SNRPB2P08579 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
SNRPB2P08579 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC26.41■■□□□ 1.82
SNRPB2P08579 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
SNRPB2P08579 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
SNRPB2P08579 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
SNRPB2P08579 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
SNRPB2P08579 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
SNRPB2P08579 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
SNRPB2P08579 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
SNRPB2P08579 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC26.35■■□□□ 1.81
SNRPB2P08579 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
SNRPB2P08579 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
SNRPB2P08579 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
SNRPB2P08579 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
SNRPB2P08579 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
SNRPB2P08579 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
SNRPB2P08579 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.8
SNRPB2P08579 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
SNRPB2P08579 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
SNRPB2P08579 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
SNRPB2P08579 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
SNRPB2P08579 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
SNRPB2P08579 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
SNRPB2P08579 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
SNRPB2P08579 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
SNRPB2P08579 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
SNRPB2P08579 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
SNRPB2P08579 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.7 ms