Protein–RNA interactions for Protein: P07202

TPO, Thyroid peroxidase, humanhuman

Predictions only

Length 933 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TPOP07202 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
TPOP07202 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
TPOP07202 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
TPOP07202 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
TPOP07202 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
TPOP07202 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
TPOP07202 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
TPOP07202 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
TPOP07202 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
TPOP07202 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
TPOP07202 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
TPOP07202 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
TPOP07202 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
TPOP07202 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC25.27■■□□□ 1.64
TPOP07202 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
TPOP07202 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
TPOP07202 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
TPOP07202 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
TPOP07202 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
TPOP07202 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC25.25■■□□□ 1.63
TPOP07202 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
TPOP07202 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
TPOP07202 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
TPOP07202 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
TPOP07202 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
TPOP07202 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
TPOP07202 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
TPOP07202 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
TPOP07202 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
TPOP07202 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
TPOP07202 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
TPOP07202 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
TPOP07202 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
TPOP07202 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
TPOP07202 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
TPOP07202 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
TPOP07202 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
TPOP07202 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
TPOP07202 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
TPOP07202 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
TPOP07202 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
TPOP07202 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
TPOP07202 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
TPOP07202 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
TPOP07202 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
TPOP07202 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
TPOP07202 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
TPOP07202 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
TPOP07202 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
TPOP07202 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
TPOP07202 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
TPOP07202 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
TPOP07202 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
TPOP07202 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
TPOP07202 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
TPOP07202 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC25.02■■□□□ 1.6
TPOP07202 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
TPOP07202 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
TPOP07202 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
TPOP07202 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
TPOP07202 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
TPOP07202 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
TPOP07202 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
TPOP07202 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
TPOP07202 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
TPOP07202 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
TPOP07202 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
TPOP07202 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
TPOP07202 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
TPOP07202 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
TPOP07202 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
TPOP07202 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
TPOP07202 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
TPOP07202 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
TPOP07202 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
TPOP07202 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
TPOP07202 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
TPOP07202 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
TPOP07202 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
TPOP07202 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
TPOP07202 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
TPOP07202 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
TPOP07202 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
TPOP07202 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
TPOP07202 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
TPOP07202 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
TPOP07202 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
TPOP07202 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
TPOP07202 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
TPOP07202 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
TPOP07202 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
TPOP07202 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC24.79■■□□□ 1.56
TPOP07202 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC24.79■■□□□ 1.56
TPOP07202 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
TPOP07202 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
TPOP07202 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
TPOP07202 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
TPOP07202 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
TPOP07202 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
TPOP07202 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.7 ms