Protein–RNA interactions for Protein: P06727

APOA4, Apolipoprotein A-IV, humanhuman

Predictions only

Length 396 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOA4P06727 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
APOA4P06727 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
APOA4P06727 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
APOA4P06727 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
APOA4P06727 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
APOA4P06727 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
APOA4P06727 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC27.8■■■□□ 2.04
APOA4P06727 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
APOA4P06727 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
APOA4P06727 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
APOA4P06727 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
APOA4P06727 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
APOA4P06727 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
APOA4P06727 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC27.73■■■□□ 2.03
APOA4P06727 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
APOA4P06727 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
APOA4P06727 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
APOA4P06727 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
APOA4P06727 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
APOA4P06727 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
APOA4P06727 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
APOA4P06727 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
APOA4P06727 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
APOA4P06727 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC27.66■■■□□ 2.02
APOA4P06727 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC27.66■■■□□ 2.02
APOA4P06727 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
APOA4P06727 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
APOA4P06727 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
APOA4P06727 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC27.64■■■□□ 2.02
APOA4P06727 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
APOA4P06727 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
APOA4P06727 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC27.62■■■□□ 2.01
APOA4P06727 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
APOA4P06727 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
APOA4P06727 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
APOA4P06727 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
APOA4P06727 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
APOA4P06727 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
APOA4P06727 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
APOA4P06727 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
APOA4P06727 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
APOA4P06727 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC27.55■■■□□ 2
APOA4P06727 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
APOA4P06727 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
APOA4P06727 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
APOA4P06727 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
APOA4P06727 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
APOA4P06727 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
APOA4P06727 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
APOA4P06727 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
APOA4P06727 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
APOA4P06727 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
APOA4P06727 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.47■■□□□ 1.99
APOA4P06727 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
APOA4P06727 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
APOA4P06727 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
APOA4P06727 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC27.44■■□□□ 1.98
APOA4P06727 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
APOA4P06727 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
APOA4P06727 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
APOA4P06727 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
APOA4P06727 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
APOA4P06727 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
APOA4P06727 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC27.39■■□□□ 1.98
APOA4P06727 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
APOA4P06727 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC27.38■■□□□ 1.97
APOA4P06727 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
APOA4P06727 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
APOA4P06727 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC27.37■■□□□ 1.97
APOA4P06727 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC27.36■■□□□ 1.97
APOA4P06727 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
APOA4P06727 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
APOA4P06727 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC27.33■■□□□ 1.97
APOA4P06727 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
APOA4P06727 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
APOA4P06727 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
APOA4P06727 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
APOA4P06727 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
APOA4P06727 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
APOA4P06727 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
APOA4P06727 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
APOA4P06727 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
APOA4P06727 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
APOA4P06727 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
APOA4P06727 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
APOA4P06727 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
APOA4P06727 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
APOA4P06727 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
APOA4P06727 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC27.21■■□□□ 1.95
APOA4P06727 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
APOA4P06727 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
APOA4P06727 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
APOA4P06727 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
APOA4P06727 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
APOA4P06727 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
APOA4P06727 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
APOA4P06727 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
APOA4P06727 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.17■■□□□ 1.94
APOA4P06727 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC27.17■■□□□ 1.94
APOA4P06727 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.2 ms