Protein–RNA interactions for Protein: P05814

CSN2, Beta-casein, humanhuman

Predictions only

Length 226 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSN2P05814 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CSN2P05814 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CSN2P05814 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CSN2P05814 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
CSN2P05814 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CSN2P05814 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
CSN2P05814 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CSN2P05814 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
CSN2P05814 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
CSN2P05814 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC23.79■■□□□ 1.4
CSN2P05814 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CSN2P05814 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CSN2P05814 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CSN2P05814 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CSN2P05814 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CSN2P05814 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CSN2P05814 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CSN2P05814 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CSN2P05814 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CSN2P05814 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CSN2P05814 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CSN2P05814 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CSN2P05814 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CSN2P05814 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CSN2P05814 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CSN2P05814 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CSN2P05814 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CSN2P05814 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CSN2P05814 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CSN2P05814 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CSN2P05814 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CSN2P05814 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CSN2P05814 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CSN2P05814 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CSN2P05814 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CSN2P05814 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CSN2P05814 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CSN2P05814 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CSN2P05814 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CSN2P05814 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CSN2P05814 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CSN2P05814 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CSN2P05814 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CSN2P05814 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CSN2P05814 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CSN2P05814 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CSN2P05814 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CSN2P05814 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CSN2P05814 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CSN2P05814 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CSN2P05814 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CSN2P05814 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CSN2P05814 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CSN2P05814 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CSN2P05814 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CSN2P05814 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CSN2P05814 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CSN2P05814 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CSN2P05814 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
CSN2P05814 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CSN2P05814 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CSN2P05814 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CSN2P05814 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CSN2P05814 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CSN2P05814 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CSN2P05814 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CSN2P05814 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CSN2P05814 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CSN2P05814 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CSN2P05814 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CSN2P05814 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CSN2P05814 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CSN2P05814 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CSN2P05814 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CSN2P05814 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CSN2P05814 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CSN2P05814 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CSN2P05814 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CSN2P05814 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CSN2P05814 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CSN2P05814 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CSN2P05814 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CSN2P05814 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CSN2P05814 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CSN2P05814 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CSN2P05814 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CSN2P05814 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CSN2P05814 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CSN2P05814 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CSN2P05814 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CSN2P05814 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
CSN2P05814 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CSN2P05814 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CSN2P05814 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CSN2P05814 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CSN2P05814 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
CSN2P05814 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CSN2P05814 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CSN2P05814 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CSN2P05814 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.4 ms