Protein–RNA interactions for Protein: P04637

TP53, Cellular tumor antigen p53, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 393 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TP53P04637 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
TP53P04637 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
TP53P04637 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
TP53P04637 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
TP53P04637 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC25.45■■□□□ 1.66
TP53P04637 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
TP53P04637 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
TP53P04637 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
TP53P04637 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
TP53P04637 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
TP53P04637 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
TP53P04637 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
TP53P04637 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
TP53P04637 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
TP53P04637 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
TP53P04637 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
TP53P04637 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
TP53P04637 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
TP53P04637 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
TP53P04637 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
TP53P04637 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
TP53P04637 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
TP53P04637 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
TP53P04637 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
TP53P04637 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
TP53P04637 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
TP53P04637 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
TP53P04637 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
TP53P04637 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
TP53P04637 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
TP53P04637 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
TP53P04637 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC25.23■■□□□ 1.63
TP53P04637 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
TP53P04637 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
TP53P04637 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
TP53P04637 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
TP53P04637 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
TP53P04637 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
TP53P04637 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
TP53P04637 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
TP53P04637 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
TP53P04637 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
TP53P04637 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
TP53P04637 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
TP53P04637 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC25.17■■□□□ 1.62
TP53P04637 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
TP53P04637 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
TP53P04637 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
TP53P04637 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
TP53P04637 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
TP53P04637 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
TP53P04637 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
TP53P04637 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
TP53P04637 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
TP53P04637 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
TP53P04637 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
TP53P04637 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
TP53P04637 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
TP53P04637 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
TP53P04637 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
TP53P04637 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
TP53P04637 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
TP53P04637 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
TP53P04637 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
TP53P04637 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
TP53P04637 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
TP53P04637 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
TP53P04637 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
TP53P04637 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
TP53P04637 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
TP53P04637 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
TP53P04637 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
TP53P04637 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
TP53P04637 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
TP53P04637 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
TP53P04637 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
TP53P04637 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
TP53P04637 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
TP53P04637 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
TP53P04637 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
TP53P04637 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
TP53P04637 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
TP53P04637 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
TP53P04637 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
TP53P04637 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
TP53P04637 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
TP53P04637 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
TP53P04637 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
TP53P04637 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
TP53P04637 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
TP53P04637 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
TP53P04637 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
TP53P04637 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
TP53P04637 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
TP53P04637 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
TP53P04637 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
TP53P04637 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
TP53P04637 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
TP53P04637 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
TP53P04637 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.7 ms