Protein–RNA interactions for Protein: P04004

VTN, Vitronectin, humanhuman

Predictions only

Length 478 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VTNP04004 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
VTNP04004 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC30.92■■■□□ 2.54
VTNP04004 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
VTNP04004 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
VTNP04004 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC30.9■■■□□ 2.54
VTNP04004 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC30.9■■■□□ 2.54
VTNP04004 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC30.89■■■□□ 2.54
VTNP04004 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.53
VTNP04004 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
VTNP04004 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
VTNP04004 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
VTNP04004 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
VTNP04004 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
VTNP04004 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC30.79■■■□□ 2.52
VTNP04004 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC30.79■■■□□ 2.52
VTNP04004 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC30.77■■■□□ 2.52
VTNP04004 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC30.77■■■□□ 2.52
VTNP04004 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC30.77■■■□□ 2.52
VTNP04004 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
VTNP04004 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.75■■■□□ 2.51
VTNP04004 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
VTNP04004 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC30.72■■■□□ 2.51
VTNP04004 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
VTNP04004 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.51
VTNP04004 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.51
VTNP04004 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.68■■■□□ 2.5
VTNP04004 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC30.68■■■□□ 2.5
VTNP04004 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.67■■■□□ 2.5
VTNP04004 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.65■■■□□ 2.5
VTNP04004 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.65■■■□□ 2.5
VTNP04004 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC30.64■■■□□ 2.5
VTNP04004 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.63■■■□□ 2.49
VTNP04004 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
VTNP04004 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
VTNP04004 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC30.61■■■□□ 2.49
VTNP04004 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
VTNP04004 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
VTNP04004 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC30.59■■■□□ 2.49
VTNP04004 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.49
VTNP04004 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.57■■■□□ 2.48
VTNP04004 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC30.56■■■□□ 2.48
VTNP04004 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
VTNP04004 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC30.51■■■□□ 2.47
VTNP04004 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
VTNP04004 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC30.5■■■□□ 2.47
VTNP04004 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
VTNP04004 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC30.49■■■□□ 2.47
VTNP04004 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
VTNP04004 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
VTNP04004 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
VTNP04004 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
VTNP04004 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
VTNP04004 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC30.46■■■□□ 2.47
VTNP04004 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.46■■■□□ 2.47
VTNP04004 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.47
VTNP04004 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC30.44■■■□□ 2.46
VTNP04004 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
VTNP04004 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
VTNP04004 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC30.37■■■□□ 2.45
VTNP04004 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
VTNP04004 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
VTNP04004 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC30.35■■■□□ 2.45
VTNP04004 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC30.35■■■□□ 2.45
VTNP04004 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC30.34■■■□□ 2.45
VTNP04004 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC30.34■■■□□ 2.45
VTNP04004 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
VTNP04004 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
VTNP04004 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
VTNP04004 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
VTNP04004 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC30.32■■■□□ 2.44
VTNP04004 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
VTNP04004 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
VTNP04004 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC30.3■■■□□ 2.44
VTNP04004 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
VTNP04004 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.29■■■□□ 2.44
VTNP04004 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
VTNP04004 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
VTNP04004 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.29■■■□□ 2.44
VTNP04004 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
VTNP04004 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC30.28■■■□□ 2.44
VTNP04004 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
VTNP04004 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
VTNP04004 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
VTNP04004 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC30.28■■■□□ 2.44
VTNP04004 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC30.28■■■□□ 2.44
VTNP04004 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
VTNP04004 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
VTNP04004 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
VTNP04004 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
VTNP04004 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC30.22■■■□□ 2.43
VTNP04004 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC30.21■■■□□ 2.43
VTNP04004 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
VTNP04004 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
VTNP04004 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
VTNP04004 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC30.17■■■□□ 2.42
VTNP04004 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
VTNP04004 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC30.17■■■□□ 2.42
VTNP04004 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
VTNP04004 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC30.16■■■□□ 2.42
VTNP04004 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC30.14■■■□□ 2.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.8 ms