Protein–RNA interactions for Protein: P01703

IGLV1-40, Immunoglobulin lambda variable 1-40, humanhuman

Predictions only

Length 118 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IGLV1-40P01703 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
IGLV1-40P01703 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
IGLV1-40P01703 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
IGLV1-40P01703 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC21.69■■□□□ 1.06
IGLV1-40P01703 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
IGLV1-40P01703 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
IGLV1-40P01703 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
IGLV1-40P01703 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
IGLV1-40P01703 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
IGLV1-40P01703 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC21.67■■□□□ 1.06
IGLV1-40P01703 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC21.66■■□□□ 1.06
IGLV1-40P01703 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
IGLV1-40P01703 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
IGLV1-40P01703 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
IGLV1-40P01703 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
IGLV1-40P01703 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
IGLV1-40P01703 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
IGLV1-40P01703 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
IGLV1-40P01703 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
IGLV1-40P01703 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
IGLV1-40P01703 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
IGLV1-40P01703 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
IGLV1-40P01703 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
IGLV1-40P01703 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
IGLV1-40P01703 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
IGLV1-40P01703 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
IGLV1-40P01703 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
IGLV1-40P01703 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
IGLV1-40P01703 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
IGLV1-40P01703 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
IGLV1-40P01703 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
IGLV1-40P01703 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
IGLV1-40P01703 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
IGLV1-40P01703 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
IGLV1-40P01703 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
IGLV1-40P01703 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
IGLV1-40P01703 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
IGLV1-40P01703 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
IGLV1-40P01703 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
IGLV1-40P01703 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
IGLV1-40P01703 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
IGLV1-40P01703 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
IGLV1-40P01703 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
IGLV1-40P01703 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
IGLV1-40P01703 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
IGLV1-40P01703 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
IGLV1-40P01703 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
IGLV1-40P01703 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
IGLV1-40P01703 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
IGLV1-40P01703 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
IGLV1-40P01703 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
IGLV1-40P01703 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
IGLV1-40P01703 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
IGLV1-40P01703 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
IGLV1-40P01703 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
IGLV1-40P01703 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
IGLV1-40P01703 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
IGLV1-40P01703 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
IGLV1-40P01703 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
IGLV1-40P01703 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
IGLV1-40P01703 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
IGLV1-40P01703 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
IGLV1-40P01703 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
IGLV1-40P01703 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
IGLV1-40P01703 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
IGLV1-40P01703 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
IGLV1-40P01703 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
IGLV1-40P01703 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
IGLV1-40P01703 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
IGLV1-40P01703 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
IGLV1-40P01703 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
IGLV1-40P01703 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
IGLV1-40P01703 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
IGLV1-40P01703 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
IGLV1-40P01703 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
IGLV1-40P01703 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
IGLV1-40P01703 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
IGLV1-40P01703 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
IGLV1-40P01703 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
IGLV1-40P01703 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC21.31■■□□□ 1
IGLV1-40P01703 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC21.31■■□□□ 1
IGLV1-40P01703 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
IGLV1-40P01703 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
IGLV1-40P01703 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
IGLV1-40P01703 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
IGLV1-40P01703 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
IGLV1-40P01703 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
IGLV1-40P01703 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
IGLV1-40P01703 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
IGLV1-40P01703 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC21.28■■□□□ 1
IGLV1-40P01703 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC21.27■■□□□ 1
IGLV1-40P01703 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
IGLV1-40P01703 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
IGLV1-40P01703 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
IGLV1-40P01703 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
IGLV1-40P01703 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
IGLV1-40P01703 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
IGLV1-40P01703 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
IGLV1-40P01703 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
IGLV1-40P01703 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.2 ms