Protein–RNA interactions for Protein: O60613

SELENOF, Selenoprotein F, humanhuman

Predictions only

Length 162 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SELENOFO60613 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SELENOFO60613 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SELENOFO60613 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
SELENOFO60613 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SELENOFO60613 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SELENOFO60613 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SELENOFO60613 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SELENOFO60613 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SELENOFO60613 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SELENOFO60613 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SELENOFO60613 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC24.7■■□□□ 1.54
SELENOFO60613 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SELENOFO60613 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SELENOFO60613 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
SELENOFO60613 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SELENOFO60613 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SELENOFO60613 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SELENOFO60613 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SELENOFO60613 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
SELENOFO60613 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
SELENOFO60613 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SELENOFO60613 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SELENOFO60613 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SELENOFO60613 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SELENOFO60613 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SELENOFO60613 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SELENOFO60613 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC24.6■■□□□ 1.53
SELENOFO60613 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SELENOFO60613 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SELENOFO60613 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
SELENOFO60613 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.52
SELENOFO60613 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SELENOFO60613 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SELENOFO60613 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
SELENOFO60613 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SELENOFO60613 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SELENOFO60613 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SELENOFO60613 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
SELENOFO60613 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SELENOFO60613 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SELENOFO60613 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SELENOFO60613 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SELENOFO60613 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SELENOFO60613 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SELENOFO60613 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SELENOFO60613 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
SELENOFO60613 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SELENOFO60613 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SELENOFO60613 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SELENOFO60613 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SELENOFO60613 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SELENOFO60613 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SELENOFO60613 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
SELENOFO60613 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
SELENOFO60613 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SELENOFO60613 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SELENOFO60613 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SELENOFO60613 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SELENOFO60613 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SELENOFO60613 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SELENOFO60613 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
SELENOFO60613 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
SELENOFO60613 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SELENOFO60613 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SELENOFO60613 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SELENOFO60613 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SELENOFO60613 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SELENOFO60613 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SELENOFO60613 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SELENOFO60613 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
SELENOFO60613 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SELENOFO60613 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SELENOFO60613 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
SELENOFO60613 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SELENOFO60613 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SELENOFO60613 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SELENOFO60613 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SELENOFO60613 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SELENOFO60613 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SELENOFO60613 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SELENOFO60613 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SELENOFO60613 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SELENOFO60613 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SELENOFO60613 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SELENOFO60613 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
SELENOFO60613 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SELENOFO60613 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SELENOFO60613 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SELENOFO60613 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SELENOFO60613 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SELENOFO60613 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SELENOFO60613 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SELENOFO60613 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SELENOFO60613 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SELENOFO60613 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SELENOFO60613 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SELENOFO60613 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SELENOFO60613 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SELENOFO60613 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SELENOFO60613 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.3 ms