Protein–RNA interactions for Protein: O60279

SUSD5, Sushi domain-containing protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 629 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SUSD5O60279 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
SUSD5O60279 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
SUSD5O60279 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
SUSD5O60279 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
SUSD5O60279 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
SUSD5O60279 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
SUSD5O60279 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
SUSD5O60279 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
SUSD5O60279 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
SUSD5O60279 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
SUSD5O60279 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
SUSD5O60279 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
SUSD5O60279 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
SUSD5O60279 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
SUSD5O60279 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
SUSD5O60279 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
SUSD5O60279 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SUSD5O60279 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC25.41■■□□□ 1.66
SUSD5O60279 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
SUSD5O60279 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SUSD5O60279 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SUSD5O60279 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SUSD5O60279 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
SUSD5O60279 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.65
SUSD5O60279 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SUSD5O60279 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
SUSD5O60279 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SUSD5O60279 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
SUSD5O60279 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
SUSD5O60279 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
SUSD5O60279 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SUSD5O60279 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
SUSD5O60279 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
SUSD5O60279 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
SUSD5O60279 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SUSD5O60279 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SUSD5O60279 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
SUSD5O60279 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SUSD5O60279 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SUSD5O60279 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SUSD5O60279 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SUSD5O60279 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SUSD5O60279 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SUSD5O60279 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SUSD5O60279 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SUSD5O60279 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
SUSD5O60279 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
SUSD5O60279 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SUSD5O60279 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SUSD5O60279 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SUSD5O60279 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SUSD5O60279 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SUSD5O60279 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC25.2■■□□□ 1.62
SUSD5O60279 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
SUSD5O60279 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
SUSD5O60279 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
SUSD5O60279 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SUSD5O60279 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SUSD5O60279 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SUSD5O60279 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
SUSD5O60279 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SUSD5O60279 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SUSD5O60279 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SUSD5O60279 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
SUSD5O60279 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SUSD5O60279 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
SUSD5O60279 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
SUSD5O60279 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
SUSD5O60279 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
SUSD5O60279 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
SUSD5O60279 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SUSD5O60279 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
SUSD5O60279 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SUSD5O60279 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SUSD5O60279 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SUSD5O60279 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SUSD5O60279 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
SUSD5O60279 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SUSD5O60279 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
SUSD5O60279 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
SUSD5O60279 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
SUSD5O60279 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
SUSD5O60279 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SUSD5O60279 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
SUSD5O60279 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
SUSD5O60279 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
SUSD5O60279 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
SUSD5O60279 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
SUSD5O60279 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SUSD5O60279 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SUSD5O60279 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SUSD5O60279 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SUSD5O60279 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SUSD5O60279 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SUSD5O60279 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
SUSD5O60279 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
SUSD5O60279 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SUSD5O60279 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
SUSD5O60279 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC24.98■■□□□ 1.59
SUSD5O60279 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.1 ms