Protein–RNA interactions for Protein: O60248

SOX15, Protein SOX-15, humanhuman

Predictions only

Length 233 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOX15O60248 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SOX15O60248 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SOX15O60248 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
SOX15O60248 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SOX15O60248 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SOX15O60248 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SOX15O60248 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SOX15O60248 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SOX15O60248 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SOX15O60248 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SOX15O60248 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SOX15O60248 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SOX15O60248 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SOX15O60248 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SOX15O60248 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SOX15O60248 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SOX15O60248 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SOX15O60248 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SOX15O60248 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SOX15O60248 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SOX15O60248 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SOX15O60248 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SOX15O60248 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SOX15O60248 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SOX15O60248 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SOX15O60248 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SOX15O60248 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SOX15O60248 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SOX15O60248 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SOX15O60248 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SOX15O60248 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SOX15O60248 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SOX15O60248 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SOX15O60248 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SOX15O60248 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SOX15O60248 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
SOX15O60248 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SOX15O60248 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SOX15O60248 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SOX15O60248 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SOX15O60248 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SOX15O60248 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SOX15O60248 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SOX15O60248 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SOX15O60248 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SOX15O60248 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SOX15O60248 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SOX15O60248 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
SOX15O60248 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SOX15O60248 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SOX15O60248 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SOX15O60248 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SOX15O60248 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SOX15O60248 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SOX15O60248 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SOX15O60248 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SOX15O60248 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SOX15O60248 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
SOX15O60248 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SOX15O60248 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SOX15O60248 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SOX15O60248 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SOX15O60248 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SOX15O60248 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SOX15O60248 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SOX15O60248 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
SOX15O60248 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SOX15O60248 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SOX15O60248 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SOX15O60248 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SOX15O60248 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SOX15O60248 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SOX15O60248 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SOX15O60248 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SOX15O60248 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SOX15O60248 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SOX15O60248 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SOX15O60248 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SOX15O60248 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SOX15O60248 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SOX15O60248 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SOX15O60248 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SOX15O60248 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SOX15O60248 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SOX15O60248 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SOX15O60248 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SOX15O60248 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SOX15O60248 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SOX15O60248 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SOX15O60248 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SOX15O60248 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
SOX15O60248 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SOX15O60248 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SOX15O60248 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SOX15O60248 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SOX15O60248 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SOX15O60248 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SOX15O60248 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
SOX15O60248 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SOX15O60248 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 96.8 ms