Protein–RNA interactions for Protein: O60225

SSX5, Protein SSX5, humanhuman

Predictions only

Length 188 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSX5O60225 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SSX5O60225 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SSX5O60225 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SSX5O60225 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SSX5O60225 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SSX5O60225 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SSX5O60225 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SSX5O60225 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SSX5O60225 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SSX5O60225 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
SSX5O60225 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SSX5O60225 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SSX5O60225 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SSX5O60225 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SSX5O60225 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SSX5O60225 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SSX5O60225 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SSX5O60225 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SSX5O60225 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SSX5O60225 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SSX5O60225 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
SSX5O60225 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SSX5O60225 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SSX5O60225 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SSX5O60225 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SSX5O60225 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SSX5O60225 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SSX5O60225 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC23.52■■□□□ 1.35
SSX5O60225 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SSX5O60225 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SSX5O60225 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SSX5O60225 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SSX5O60225 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SSX5O60225 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SSX5O60225 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SSX5O60225 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
SSX5O60225 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SSX5O60225 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SSX5O60225 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SSX5O60225 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SSX5O60225 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SSX5O60225 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SSX5O60225 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SSX5O60225 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
SSX5O60225 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
SSX5O60225 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SSX5O60225 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SSX5O60225 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
SSX5O60225 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
SSX5O60225 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
SSX5O60225 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
SSX5O60225 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SSX5O60225 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SSX5O60225 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SSX5O60225 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SSX5O60225 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SSX5O60225 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SSX5O60225 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SSX5O60225 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SSX5O60225 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SSX5O60225 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SSX5O60225 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SSX5O60225 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SSX5O60225 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SSX5O60225 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SSX5O60225 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SSX5O60225 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SSX5O60225 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SSX5O60225 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SSX5O60225 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SSX5O60225 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SSX5O60225 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SSX5O60225 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SSX5O60225 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SSX5O60225 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SSX5O60225 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SSX5O60225 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SSX5O60225 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SSX5O60225 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SSX5O60225 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SSX5O60225 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SSX5O60225 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
SSX5O60225 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SSX5O60225 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SSX5O60225 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SSX5O60225 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SSX5O60225 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SSX5O60225 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SSX5O60225 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SSX5O60225 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SSX5O60225 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SSX5O60225 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SSX5O60225 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SSX5O60225 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SSX5O60225 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SSX5O60225 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SSX5O60225 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SSX5O60225 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SSX5O60225 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SSX5O60225 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 87.7 ms