Protein–RNA interactions for Protein: O43896

KIF1C, Kinesin-like protein KIF1C, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,103 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KIF1CO43896 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC27.59■■■□□ 2.01
KIF1CO43896 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
KIF1CO43896 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
KIF1CO43896 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
KIF1CO43896 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
KIF1CO43896 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
KIF1CO43896 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
KIF1CO43896 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
KIF1CO43896 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
KIF1CO43896 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
KIF1CO43896 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
KIF1CO43896 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
KIF1CO43896 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
KIF1CO43896 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
KIF1CO43896 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
KIF1CO43896 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC27.5■■□□□ 1.99
KIF1CO43896 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
KIF1CO43896 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
KIF1CO43896 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
KIF1CO43896 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
KIF1CO43896 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
KIF1CO43896 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC27.44■■□□□ 1.98
KIF1CO43896 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
KIF1CO43896 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC27.43■■□□□ 1.98
KIF1CO43896 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
KIF1CO43896 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
KIF1CO43896 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
KIF1CO43896 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC27.42■■□□□ 1.98
KIF1CO43896 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
KIF1CO43896 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
KIF1CO43896 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
KIF1CO43896 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
KIF1CO43896 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
KIF1CO43896 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
KIF1CO43896 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
KIF1CO43896 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
KIF1CO43896 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
KIF1CO43896 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
KIF1CO43896 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
KIF1CO43896 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
KIF1CO43896 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
KIF1CO43896 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
KIF1CO43896 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
KIF1CO43896 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
KIF1CO43896 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
KIF1CO43896 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
KIF1CO43896 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
KIF1CO43896 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
KIF1CO43896 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
KIF1CO43896 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.96
KIF1CO43896 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
KIF1CO43896 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
KIF1CO43896 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
KIF1CO43896 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
KIF1CO43896 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
KIF1CO43896 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC27.23■■□□□ 1.95
KIF1CO43896 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
KIF1CO43896 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
KIF1CO43896 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC27.22■■□□□ 1.95
KIF1CO43896 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
KIF1CO43896 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
KIF1CO43896 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.95
KIF1CO43896 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
KIF1CO43896 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.95
KIF1CO43896 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
KIF1CO43896 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
KIF1CO43896 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
KIF1CO43896 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
KIF1CO43896 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
KIF1CO43896 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
KIF1CO43896 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
KIF1CO43896 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC27.17■■□□□ 1.94
KIF1CO43896 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC27.17■■□□□ 1.94
KIF1CO43896 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
KIF1CO43896 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC27.15■■□□□ 1.94
KIF1CO43896 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
KIF1CO43896 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
KIF1CO43896 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
KIF1CO43896 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
KIF1CO43896 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
KIF1CO43896 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
KIF1CO43896 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
KIF1CO43896 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
KIF1CO43896 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC27.1■■□□□ 1.93
KIF1CO43896 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC27.1■■□□□ 1.93
KIF1CO43896 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
KIF1CO43896 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
KIF1CO43896 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
KIF1CO43896 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
KIF1CO43896 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
KIF1CO43896 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
KIF1CO43896 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
KIF1CO43896 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
KIF1CO43896 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
KIF1CO43896 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
KIF1CO43896 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
KIF1CO43896 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
KIF1CO43896 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
KIF1CO43896 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
KIF1CO43896 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 8 ms