Protein–RNA interactions for Protein: O43396

TXNL1, Thioredoxin-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 289 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TXNL1O43396 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TXNL1O43396 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TXNL1O43396 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
TXNL1O43396 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TXNL1O43396 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TXNL1O43396 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TXNL1O43396 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TXNL1O43396 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TXNL1O43396 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TXNL1O43396 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TXNL1O43396 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TXNL1O43396 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
TXNL1O43396 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TXNL1O43396 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TXNL1O43396 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TXNL1O43396 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TXNL1O43396 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TXNL1O43396 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
TXNL1O43396 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TXNL1O43396 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TXNL1O43396 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
TXNL1O43396 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TXNL1O43396 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TXNL1O43396 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TXNL1O43396 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TXNL1O43396 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TXNL1O43396 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
TXNL1O43396 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TXNL1O43396 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
TXNL1O43396 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TXNL1O43396 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TXNL1O43396 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TXNL1O43396 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TXNL1O43396 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TXNL1O43396 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TXNL1O43396 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TXNL1O43396 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TXNL1O43396 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TXNL1O43396 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TXNL1O43396 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TXNL1O43396 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
TXNL1O43396 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TXNL1O43396 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TXNL1O43396 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TXNL1O43396 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TXNL1O43396 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TXNL1O43396 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TXNL1O43396 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TXNL1O43396 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TXNL1O43396 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TXNL1O43396 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TXNL1O43396 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TXNL1O43396 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TXNL1O43396 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TXNL1O43396 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TXNL1O43396 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TXNL1O43396 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TXNL1O43396 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TXNL1O43396 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TXNL1O43396 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TXNL1O43396 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TXNL1O43396 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TXNL1O43396 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TXNL1O43396 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TXNL1O43396 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TXNL1O43396 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TXNL1O43396 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
TXNL1O43396 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
TXNL1O43396 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
TXNL1O43396 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
TXNL1O43396 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
TXNL1O43396 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TXNL1O43396 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TXNL1O43396 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TXNL1O43396 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TXNL1O43396 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TXNL1O43396 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TXNL1O43396 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TXNL1O43396 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TXNL1O43396 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TXNL1O43396 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TXNL1O43396 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TXNL1O43396 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
TXNL1O43396 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TXNL1O43396 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TXNL1O43396 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TXNL1O43396 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TXNL1O43396 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TXNL1O43396 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TXNL1O43396 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TXNL1O43396 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TXNL1O43396 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TXNL1O43396 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TXNL1O43396 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
TXNL1O43396 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TXNL1O43396 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TXNL1O43396 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TXNL1O43396 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TXNL1O43396 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TXNL1O43396 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.5 ms