Protein–RNA interactions for Protein: O43272

PRODH, Proline dehydrogenase 1, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 600 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRODHO43272 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PRODHO43272 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PRODHO43272 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PRODHO43272 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PRODHO43272 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
PRODHO43272 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
PRODHO43272 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PRODHO43272 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PRODHO43272 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
PRODHO43272 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
PRODHO43272 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
PRODHO43272 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
PRODHO43272 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
PRODHO43272 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
PRODHO43272 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
PRODHO43272 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
PRODHO43272 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
PRODHO43272 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
PRODHO43272 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
PRODHO43272 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
PRODHO43272 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
PRODHO43272 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PRODHO43272 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PRODHO43272 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
PRODHO43272 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PRODHO43272 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
PRODHO43272 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
PRODHO43272 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
PRODHO43272 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PRODHO43272 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
PRODHO43272 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
PRODHO43272 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
PRODHO43272 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
PRODHO43272 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
PRODHO43272 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PRODHO43272 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC24.9■■□□□ 1.58
PRODHO43272 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
PRODHO43272 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
PRODHO43272 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
PRODHO43272 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PRODHO43272 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
PRODHO43272 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
PRODHO43272 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC24.87■■□□□ 1.57
PRODHO43272 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
PRODHO43272 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PRODHO43272 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PRODHO43272 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PRODHO43272 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
PRODHO43272 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
PRODHO43272 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
PRODHO43272 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PRODHO43272 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
PRODHO43272 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PRODHO43272 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
PRODHO43272 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PRODHO43272 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
PRODHO43272 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PRODHO43272 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PRODHO43272 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
PRODHO43272 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
PRODHO43272 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PRODHO43272 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PRODHO43272 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
PRODHO43272 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
PRODHO43272 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PRODHO43272 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PRODHO43272 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PRODHO43272 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PRODHO43272 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
PRODHO43272 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PRODHO43272 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.55
PRODHO43272 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
PRODHO43272 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
PRODHO43272 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
PRODHO43272 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PRODHO43272 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PRODHO43272 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PRODHO43272 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
PRODHO43272 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
PRODHO43272 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PRODHO43272 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PRODHO43272 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
PRODHO43272 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PRODHO43272 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
PRODHO43272 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
PRODHO43272 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PRODHO43272 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
PRODHO43272 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PRODHO43272 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PRODHO43272 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PRODHO43272 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PRODHO43272 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PRODHO43272 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
PRODHO43272 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PRODHO43272 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PRODHO43272 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PRODHO43272 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
PRODHO43272 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
PRODHO43272 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PRODHO43272 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.1 ms