Protein–RNA interactions for Protein: O15480

MAGEB3, Melanoma-associated antigen B3, humanhuman

Predictions only

Length 346 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MAGEB3O15480 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
MAGEB3O15480 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
MAGEB3O15480 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
MAGEB3O15480 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
MAGEB3O15480 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
MAGEB3O15480 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
MAGEB3O15480 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
MAGEB3O15480 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
MAGEB3O15480 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
MAGEB3O15480 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
MAGEB3O15480 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
MAGEB3O15480 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
MAGEB3O15480 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
MAGEB3O15480 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
MAGEB3O15480 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
MAGEB3O15480 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
MAGEB3O15480 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
MAGEB3O15480 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
MAGEB3O15480 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
MAGEB3O15480 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
MAGEB3O15480 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
MAGEB3O15480 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
MAGEB3O15480 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
MAGEB3O15480 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
MAGEB3O15480 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
MAGEB3O15480 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
MAGEB3O15480 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
MAGEB3O15480 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
MAGEB3O15480 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
MAGEB3O15480 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
MAGEB3O15480 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
MAGEB3O15480 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
MAGEB3O15480 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
MAGEB3O15480 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
MAGEB3O15480 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
MAGEB3O15480 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.6
MAGEB3O15480 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
MAGEB3O15480 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC25■■□□□ 1.59
MAGEB3O15480 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
MAGEB3O15480 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
MAGEB3O15480 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
MAGEB3O15480 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
MAGEB3O15480 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
MAGEB3O15480 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
MAGEB3O15480 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
MAGEB3O15480 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.59
MAGEB3O15480 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
MAGEB3O15480 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
MAGEB3O15480 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
MAGEB3O15480 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
MAGEB3O15480 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
MAGEB3O15480 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
MAGEB3O15480 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
MAGEB3O15480 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
MAGEB3O15480 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
MAGEB3O15480 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
MAGEB3O15480 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
MAGEB3O15480 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC24.85■■□□□ 1.57
MAGEB3O15480 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
MAGEB3O15480 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
MAGEB3O15480 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
MAGEB3O15480 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
MAGEB3O15480 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
MAGEB3O15480 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
MAGEB3O15480 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
MAGEB3O15480 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
MAGEB3O15480 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
MAGEB3O15480 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
MAGEB3O15480 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
MAGEB3O15480 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
MAGEB3O15480 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
MAGEB3O15480 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
MAGEB3O15480 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
MAGEB3O15480 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
MAGEB3O15480 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
MAGEB3O15480 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
MAGEB3O15480 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
MAGEB3O15480 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
MAGEB3O15480 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
MAGEB3O15480 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
MAGEB3O15480 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
MAGEB3O15480 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
MAGEB3O15480 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
MAGEB3O15480 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
MAGEB3O15480 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
MAGEB3O15480 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC24.71■■□□□ 1.55
MAGEB3O15480 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
MAGEB3O15480 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
MAGEB3O15480 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
MAGEB3O15480 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
MAGEB3O15480 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
MAGEB3O15480 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC24.67■■□□□ 1.54
MAGEB3O15480 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
MAGEB3O15480 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
MAGEB3O15480 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
MAGEB3O15480 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
MAGEB3O15480 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
MAGEB3O15480 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
MAGEB3O15480 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
MAGEB3O15480 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.9 ms