Protein–RNA interactions for Protein: O15160

POLR1C, DNA-directed RNA polymerases I and III subunit RPAC1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 346 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR1CO15160 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
POLR1CO15160 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
POLR1CO15160 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
POLR1CO15160 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC26.75■■□□□ 1.87
POLR1CO15160 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.74■■□□□ 1.87
POLR1CO15160 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
POLR1CO15160 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
POLR1CO15160 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
POLR1CO15160 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
POLR1CO15160 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
POLR1CO15160 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
POLR1CO15160 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
POLR1CO15160 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
POLR1CO15160 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
POLR1CO15160 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
POLR1CO15160 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
POLR1CO15160 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
POLR1CO15160 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
POLR1CO15160 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
POLR1CO15160 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC26.64■■□□□ 1.86
POLR1CO15160 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
POLR1CO15160 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
POLR1CO15160 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
POLR1CO15160 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
POLR1CO15160 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC26.62■■□□□ 1.85
POLR1CO15160 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
POLR1CO15160 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
POLR1CO15160 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
POLR1CO15160 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.6■■□□□ 1.85
POLR1CO15160 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
POLR1CO15160 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
POLR1CO15160 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
POLR1CO15160 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
POLR1CO15160 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
POLR1CO15160 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
POLR1CO15160 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
POLR1CO15160 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
POLR1CO15160 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
POLR1CO15160 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC26.52■■□□□ 1.84
POLR1CO15160 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
POLR1CO15160 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
POLR1CO15160 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
POLR1CO15160 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
POLR1CO15160 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
POLR1CO15160 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
POLR1CO15160 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
POLR1CO15160 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
POLR1CO15160 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
POLR1CO15160 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
POLR1CO15160 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC26.41■■□□□ 1.82
POLR1CO15160 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
POLR1CO15160 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC26.4■■□□□ 1.82
POLR1CO15160 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
POLR1CO15160 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
POLR1CO15160 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
POLR1CO15160 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
POLR1CO15160 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
POLR1CO15160 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
POLR1CO15160 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
POLR1CO15160 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
POLR1CO15160 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC26.31■■□□□ 1.8
POLR1CO15160 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
POLR1CO15160 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
POLR1CO15160 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
POLR1CO15160 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
POLR1CO15160 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
POLR1CO15160 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC26.28■■□□□ 1.8
POLR1CO15160 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
POLR1CO15160 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
POLR1CO15160 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
POLR1CO15160 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
POLR1CO15160 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
POLR1CO15160 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
POLR1CO15160 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
POLR1CO15160 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC26.25■■□□□ 1.79
POLR1CO15160 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
POLR1CO15160 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC26.24■■□□□ 1.79
POLR1CO15160 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
POLR1CO15160 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
POLR1CO15160 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
POLR1CO15160 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
POLR1CO15160 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
POLR1CO15160 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
POLR1CO15160 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
POLR1CO15160 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
POLR1CO15160 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
POLR1CO15160 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC26.18■■□□□ 1.78
POLR1CO15160 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
POLR1CO15160 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
POLR1CO15160 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
POLR1CO15160 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
POLR1CO15160 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC26.15■■□□□ 1.78
POLR1CO15160 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
POLR1CO15160 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
POLR1CO15160 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
POLR1CO15160 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
POLR1CO15160 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
POLR1CO15160 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
POLR1CO15160 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
POLR1CO15160 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71.5 ms