Protein–RNA interactions for Protein: O15061

SYNM, Synemin, humanhuman

Predictions only

Length 1,565 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNMO15061 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.32■■■■■ 4.21
SYNMO15061 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.31■■■■■ 4.2
SYNMO15061 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC41.3■■■■■ 4.2
SYNMO15061 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.26■■■■■ 4.2
SYNMO15061 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC41.25■■■■■ 4.19
SYNMO15061 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC41.24■■■■■ 4.19
SYNMO15061 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC41.21■■■■■ 4.19
SYNMO15061 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC41.21■■■■■ 4.19
SYNMO15061 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC41.19■■■■■ 4.18
SYNMO15061 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC41.19■■■■■ 4.18
SYNMO15061 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC41.17■■■■■ 4.18
SYNMO15061 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC41.17■■■■■ 4.18
SYNMO15061 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC41.14■■■■■ 4.18
SYNMO15061 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.1■■■■■ 4.17
SYNMO15061 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.09■■■■■ 4.17
SYNMO15061 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.08■■■■■ 4.17
SYNMO15061 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC41.07■■■■■ 4.16
SYNMO15061 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC41.07■■■■■ 4.16
SYNMO15061 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC41.05■■■■■ 4.16
SYNMO15061 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC40.99■■■■■ 4.15
SYNMO15061 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC40.97■■■■■ 4.15
SYNMO15061 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC40.95■■■■■ 4.15
SYNMO15061 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC40.95■■■■■ 4.15
SYNMO15061 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC40.95■■■■■ 4.15
SYNMO15061 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.94■■■■■ 4.15
SYNMO15061 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC40.93■■■■■ 4.14
SYNMO15061 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC40.89■■■■■ 4.14
SYNMO15061 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC40.88■■■■■ 4.13
SYNMO15061 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC40.87■■■■■ 4.13
SYNMO15061 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC40.86■■■■■ 4.13
SYNMO15061 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.84■■■■■ 4.13
SYNMO15061 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC40.81■■■■■ 4.12
SYNMO15061 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC40.81■■■■■ 4.12
SYNMO15061 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC40.8■■■■■ 4.12
SYNMO15061 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC40.79■■■■■ 4.12
SYNMO15061 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC40.78■■■■■ 4.12
SYNMO15061 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC40.78■■■■■ 4.12
SYNMO15061 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC40.77■■■■■ 4.12
SYNMO15061 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC40.77■■■■■ 4.12
SYNMO15061 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC40.77■■■■■ 4.12
SYNMO15061 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.76■■■■■ 4.12
SYNMO15061 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.76■■■■■ 4.12
SYNMO15061 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC40.75■■■■■ 4.11
SYNMO15061 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC40.75■■■■■ 4.11
SYNMO15061 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.74■■■■■ 4.11
SYNMO15061 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC40.74■■■■■ 4.11
SYNMO15061 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC40.74■■■■■ 4.11
SYNMO15061 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC40.72■■■■■ 4.11
SYNMO15061 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC40.71■■■■■ 4.11
SYNMO15061 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC40.71■■■■■ 4.11
SYNMO15061 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC40.71■■■■■ 4.11
SYNMO15061 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC40.71■■■■■ 4.11
SYNMO15061 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC40.71■■■■■ 4.11
SYNMO15061 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.69■■■■■ 4.1
SYNMO15061 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.69■■■■■ 4.1
SYNMO15061 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC40.67■■■■■ 4.1
SYNMO15061 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC40.66■■■■■ 4.1
SYNMO15061 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.65■■■■■ 4.1
SYNMO15061 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC40.65■■■■■ 4.1
SYNMO15061 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.62■■■■■ 4.09
SYNMO15061 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.62■■■■■ 4.09
SYNMO15061 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC40.6■■■■■ 4.09
SYNMO15061 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC40.6■■■■■ 4.09
SYNMO15061 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.59■■■■■ 4.09
SYNMO15061 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC40.59■■■■■ 4.09
SYNMO15061 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.58■■■■■ 4.09
SYNMO15061 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.58■■■■■ 4.09
SYNMO15061 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC40.57■■■■■ 4.09
SYNMO15061 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC40.56■■■■■ 4.08
SYNMO15061 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC40.55■■■■■ 4.08
SYNMO15061 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC40.53■■■■■ 4.08
SYNMO15061 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC40.52■■■■■ 4.08
SYNMO15061 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.52■■■■■ 4.08
SYNMO15061 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC40.52■■■■■ 4.08
SYNMO15061 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC40.51■■■■■ 4.08
SYNMO15061 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.5■■■■■ 4.07
SYNMO15061 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC40.5■■■■■ 4.07
SYNMO15061 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC40.48■■■■■ 4.07
SYNMO15061 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC40.45■■■■■ 4.07
SYNMO15061 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC40.45■■■■■ 4.07
SYNMO15061 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC40.44■■■■■ 4.06
SYNMO15061 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC40.44■■■■■ 4.06
SYNMO15061 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.43■■■■■ 4.06
SYNMO15061 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC40.42■■■■■ 4.06
SYNMO15061 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC40.41■■■■■ 4.06
SYNMO15061 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC40.37■■■■■ 4.05
SYNMO15061 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC40.37■■■■■ 4.05
SYNMO15061 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC40.36■■■■■ 4.05
SYNMO15061 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC40.35■■■■■ 4.05
SYNMO15061 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC40.34■■■■■ 4.05
SYNMO15061 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC40.31■■■■■ 4.04
SYNMO15061 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.29■■■■■ 4.04
SYNMO15061 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC40.28■■■■■ 4.04
SYNMO15061 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC40.28■■■■■ 4.04
SYNMO15061 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC40.24■■■■■ 4.03
SYNMO15061 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC40.21■■■■■ 4.03
SYNMO15061 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.2■■■■■ 4.03
SYNMO15061 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.19■■■■■ 4.02
SYNMO15061 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC40.19■■■■■ 4.02
SYNMO15061 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC40.18■■■■■ 4.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.3 ms