Protein–RNA interactions for Protein: O14717

TRDMT1, tRNA (cytosine(38)-C(5))-methyltransferase, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 391 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRDMT1O14717 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
TRDMT1O14717 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
TRDMT1O14717 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.27
TRDMT1O14717 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.26
TRDMT1O14717 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC29.19■■■□□ 2.26
TRDMT1O14717 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
TRDMT1O14717 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
TRDMT1O14717 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC29.17■■■□□ 2.26
TRDMT1O14717 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
TRDMT1O14717 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC29.16■■■□□ 2.26
TRDMT1O14717 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
TRDMT1O14717 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
TRDMT1O14717 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
TRDMT1O14717 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
TRDMT1O14717 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
TRDMT1O14717 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
TRDMT1O14717 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC29.12■■■□□ 2.25
TRDMT1O14717 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC29.12■■■□□ 2.25
TRDMT1O14717 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
TRDMT1O14717 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
TRDMT1O14717 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
TRDMT1O14717 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC29.09■■■□□ 2.25
TRDMT1O14717 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
TRDMT1O14717 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC29.08■■■□□ 2.25
TRDMT1O14717 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
TRDMT1O14717 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
TRDMT1O14717 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
TRDMT1O14717 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC29.02■■■□□ 2.24
TRDMT1O14717 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
TRDMT1O14717 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
TRDMT1O14717 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
TRDMT1O14717 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
TRDMT1O14717 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
TRDMT1O14717 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
TRDMT1O14717 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.22
TRDMT1O14717 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC28.94■■■□□ 2.22
TRDMT1O14717 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
TRDMT1O14717 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
TRDMT1O14717 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
TRDMT1O14717 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
TRDMT1O14717 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.92■■■□□ 2.22
TRDMT1O14717 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
TRDMT1O14717 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC28.9■■■□□ 2.22
TRDMT1O14717 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
TRDMT1O14717 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.89■■■□□ 2.21
TRDMT1O14717 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
TRDMT1O14717 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
TRDMT1O14717 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
TRDMT1O14717 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
TRDMT1O14717 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
TRDMT1O14717 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
TRDMT1O14717 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
TRDMT1O14717 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
TRDMT1O14717 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
TRDMT1O14717 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
TRDMT1O14717 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
TRDMT1O14717 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
TRDMT1O14717 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
TRDMT1O14717 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
TRDMT1O14717 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC28.76■■■□□ 2.19
TRDMT1O14717 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.19
TRDMT1O14717 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC28.76■■■□□ 2.19
TRDMT1O14717 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
TRDMT1O14717 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
TRDMT1O14717 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
TRDMT1O14717 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
TRDMT1O14717 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
TRDMT1O14717 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
TRDMT1O14717 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.7■■■□□ 2.18
TRDMT1O14717 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
TRDMT1O14717 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
TRDMT1O14717 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
TRDMT1O14717 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
TRDMT1O14717 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC28.68■■■□□ 2.18
TRDMT1O14717 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC28.67■■■□□ 2.18
TRDMT1O14717 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
TRDMT1O14717 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC28.65■■■□□ 2.18
TRDMT1O14717 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
TRDMT1O14717 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
TRDMT1O14717 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.18
TRDMT1O14717 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
TRDMT1O14717 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC28.63■■■□□ 2.17
TRDMT1O14717 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
TRDMT1O14717 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
TRDMT1O14717 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
TRDMT1O14717 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
TRDMT1O14717 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
TRDMT1O14717 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
TRDMT1O14717 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
TRDMT1O14717 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
TRDMT1O14717 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
TRDMT1O14717 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
TRDMT1O14717 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
TRDMT1O14717 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
TRDMT1O14717 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
TRDMT1O14717 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC28.56■■■□□ 2.16
TRDMT1O14717 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC28.55■■■□□ 2.16
TRDMT1O14717 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC28.55■■■□□ 2.16
TRDMT1O14717 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC28.55■■■□□ 2.16
TRDMT1O14717 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
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