Protein–RNA interactions for Protein: O14598

VCY, Testis-specific basic protein Y 1, humanhuman

Predictions only

Length 125 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VCYO14598 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
VCYO14598 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
VCYO14598 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC19.89■□□□□ 0.77
VCYO14598 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
VCYO14598 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
VCYO14598 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
VCYO14598 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
VCYO14598 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
VCYO14598 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
VCYO14598 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC19.81■□□□□ 0.76
VCYO14598 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
VCYO14598 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
VCYO14598 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
VCYO14598 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
VCYO14598 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
VCYO14598 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
VCYO14598 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
VCYO14598 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
VCYO14598 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
VCYO14598 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
VCYO14598 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
VCYO14598 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
VCYO14598 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC19.76■□□□□ 0.75
VCYO14598 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
VCYO14598 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
VCYO14598 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
VCYO14598 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
VCYO14598 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
VCYO14598 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
VCYO14598 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
VCYO14598 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
VCYO14598 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
VCYO14598 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
VCYO14598 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
VCYO14598 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
VCYO14598 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
VCYO14598 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
VCYO14598 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
VCYO14598 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC19.66■□□□□ 0.74
VCYO14598 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
VCYO14598 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
VCYO14598 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC19.65■□□□□ 0.74
VCYO14598 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
VCYO14598 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
VCYO14598 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
VCYO14598 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
VCYO14598 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
VCYO14598 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
VCYO14598 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
VCYO14598 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
VCYO14598 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
VCYO14598 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
VCYO14598 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
VCYO14598 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
VCYO14598 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
VCYO14598 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
VCYO14598 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
VCYO14598 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
VCYO14598 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
VCYO14598 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
VCYO14598 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
VCYO14598 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
VCYO14598 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
VCYO14598 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
VCYO14598 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
VCYO14598 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
VCYO14598 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC19.56■□□□□ 0.72
VCYO14598 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
VCYO14598 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
VCYO14598 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
VCYO14598 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
VCYO14598 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
VCYO14598 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
VCYO14598 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
VCYO14598 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
VCYO14598 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
VCYO14598 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
VCYO14598 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
VCYO14598 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
VCYO14598 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
VCYO14598 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
VCYO14598 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
VCYO14598 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
VCYO14598 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
VCYO14598 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
VCYO14598 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
VCYO14598 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
VCYO14598 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
VCYO14598 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
VCYO14598 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
VCYO14598 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
VCYO14598 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
VCYO14598 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
VCYO14598 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
VCYO14598 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
VCYO14598 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
VCYO14598 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC19.41■□□□□ 0.7
VCYO14598 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
VCYO14598 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
VCYO14598 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.5 ms