Protein–RNA interactions for Protein: O00268

TAF4, Transcription initiation factor TFIID subunit 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,085 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAF4O00268 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
TAF4O00268 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
TAF4O00268 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
TAF4O00268 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
TAF4O00268 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC27.2■■□□□ 1.94
TAF4O00268 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
TAF4O00268 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
TAF4O00268 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
TAF4O00268 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
TAF4O00268 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
TAF4O00268 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
TAF4O00268 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
TAF4O00268 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
TAF4O00268 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
TAF4O00268 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
TAF4O00268 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
TAF4O00268 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
TAF4O00268 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
TAF4O00268 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC27.08■■□□□ 1.93
TAF4O00268 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
TAF4O00268 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
TAF4O00268 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
TAF4O00268 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
TAF4O00268 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC27.04■■□□□ 1.92
TAF4O00268 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
TAF4O00268 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC27.02■■□□□ 1.92
TAF4O00268 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
TAF4O00268 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
TAF4O00268 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
TAF4O00268 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
TAF4O00268 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
TAF4O00268 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
TAF4O00268 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
TAF4O00268 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC26.97■■□□□ 1.91
TAF4O00268 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
TAF4O00268 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC26.95■■□□□ 1.91
TAF4O00268 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.91
TAF4O00268 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
TAF4O00268 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
TAF4O00268 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.89
TAF4O00268 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC26.88■■□□□ 1.89
TAF4O00268 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
TAF4O00268 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
TAF4O00268 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
TAF4O00268 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.85■■□□□ 1.89
TAF4O00268 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
TAF4O00268 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
TAF4O00268 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC26.84■■□□□ 1.89
TAF4O00268 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC26.84■■□□□ 1.89
TAF4O00268 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
TAF4O00268 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
TAF4O00268 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
TAF4O00268 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
TAF4O00268 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
TAF4O00268 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
TAF4O00268 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
TAF4O00268 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
TAF4O00268 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC26.79■■□□□ 1.88
TAF4O00268 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.78■■□□□ 1.88
TAF4O00268 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
TAF4O00268 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
TAF4O00268 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC26.77■■□□□ 1.88
TAF4O00268 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
TAF4O00268 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
TAF4O00268 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
TAF4O00268 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC26.7■■□□□ 1.87
TAF4O00268 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
TAF4O00268 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
TAF4O00268 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
TAF4O00268 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
TAF4O00268 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
TAF4O00268 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
TAF4O00268 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
TAF4O00268 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC26.66■■□□□ 1.86
TAF4O00268 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC26.66■■□□□ 1.86
TAF4O00268 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC26.65■■□□□ 1.86
TAF4O00268 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
TAF4O00268 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
TAF4O00268 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
TAF4O00268 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
TAF4O00268 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
TAF4O00268 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
TAF4O00268 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
TAF4O00268 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
TAF4O00268 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
TAF4O00268 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
TAF4O00268 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
TAF4O00268 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
TAF4O00268 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
TAF4O00268 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
TAF4O00268 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
TAF4O00268 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
TAF4O00268 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
TAF4O00268 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
TAF4O00268 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
TAF4O00268 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
TAF4O00268 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
TAF4O00268 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
TAF4O00268 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
TAF4O00268 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25 ms