Protein–RNA interactions for Protein: O00233

PSMD9, 26S proteasome non-ATPase regulatory subunit 9, humanhuman

Predictions only

Length 223 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMD9O00233 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PSMD9O00233 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
PSMD9O00233 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
PSMD9O00233 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
PSMD9O00233 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PSMD9O00233 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
PSMD9O00233 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PSMD9O00233 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PSMD9O00233 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PSMD9O00233 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PSMD9O00233 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
PSMD9O00233 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
PSMD9O00233 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PSMD9O00233 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC24.55■■□□□ 1.52
PSMD9O00233 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PSMD9O00233 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
PSMD9O00233 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
PSMD9O00233 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PSMD9O00233 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PSMD9O00233 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PSMD9O00233 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PSMD9O00233 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
PSMD9O00233 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PSMD9O00233 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PSMD9O00233 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PSMD9O00233 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PSMD9O00233 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
PSMD9O00233 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PSMD9O00233 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PSMD9O00233 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PSMD9O00233 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PSMD9O00233 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
PSMD9O00233 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
PSMD9O00233 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
PSMD9O00233 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC24.45■■□□□ 1.5
PSMD9O00233 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PSMD9O00233 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PSMD9O00233 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PSMD9O00233 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
PSMD9O00233 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
PSMD9O00233 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PSMD9O00233 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PSMD9O00233 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
PSMD9O00233 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
PSMD9O00233 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
PSMD9O00233 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
PSMD9O00233 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
PSMD9O00233 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PSMD9O00233 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PSMD9O00233 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PSMD9O00233 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PSMD9O00233 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PSMD9O00233 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PSMD9O00233 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PSMD9O00233 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
PSMD9O00233 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
PSMD9O00233 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
PSMD9O00233 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PSMD9O00233 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
PSMD9O00233 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PSMD9O00233 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PSMD9O00233 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PSMD9O00233 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PSMD9O00233 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PSMD9O00233 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PSMD9O00233 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PSMD9O00233 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PSMD9O00233 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
PSMD9O00233 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PSMD9O00233 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PSMD9O00233 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PSMD9O00233 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PSMD9O00233 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PSMD9O00233 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PSMD9O00233 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PSMD9O00233 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PSMD9O00233 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PSMD9O00233 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PSMD9O00233 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PSMD9O00233 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PSMD9O00233 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PSMD9O00233 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
PSMD9O00233 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PSMD9O00233 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PSMD9O00233 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PSMD9O00233 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PSMD9O00233 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
PSMD9O00233 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PSMD9O00233 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PSMD9O00233 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PSMD9O00233 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PSMD9O00233 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PSMD9O00233 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PSMD9O00233 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PSMD9O00233 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
PSMD9O00233 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
PSMD9O00233 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
PSMD9O00233 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PSMD9O00233 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PSMD9O00233 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.6 ms