Protein–RNA interactions for Protein: O00220

TNFRSF10A, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 10A, humanhuman

Predictions only

Length 468 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFRSF10AO00220 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.92■■■□□ 2.38
TNFRSF10AO00220 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.92■■■□□ 2.38
TNFRSF10AO00220 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
TNFRSF10AO00220 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
TNFRSF10AO00220 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.9■■■□□ 2.38
TNFRSF10AO00220 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
TNFRSF10AO00220 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
TNFRSF10AO00220 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC29.86■■■□□ 2.37
TNFRSF10AO00220 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
TNFRSF10AO00220 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC29.84■■■□□ 2.37
TNFRSF10AO00220 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
TNFRSF10AO00220 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC29.83■■■□□ 2.37
TNFRSF10AO00220 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
TNFRSF10AO00220 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
TNFRSF10AO00220 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
TNFRSF10AO00220 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC29.78■■■□□ 2.36
TNFRSF10AO00220 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC29.76■■■□□ 2.35
TNFRSF10AO00220 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC29.76■■■□□ 2.35
TNFRSF10AO00220 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.75■■■□□ 2.35
TNFRSF10AO00220 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
TNFRSF10AO00220 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.72■■■□□ 2.35
TNFRSF10AO00220 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC29.72■■■□□ 2.35
TNFRSF10AO00220 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
TNFRSF10AO00220 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC29.7■■■□□ 2.35
TNFRSF10AO00220 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC29.7■■■□□ 2.35
TNFRSF10AO00220 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.69■■■□□ 2.34
TNFRSF10AO00220 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
TNFRSF10AO00220 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC29.63■■■□□ 2.33
TNFRSF10AO00220 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC29.63■■■□□ 2.33
TNFRSF10AO00220 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
TNFRSF10AO00220 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC29.58■■■□□ 2.33
TNFRSF10AO00220 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.58■■■□□ 2.33
TNFRSF10AO00220 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC29.58■■■□□ 2.33
TNFRSF10AO00220 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
TNFRSF10AO00220 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
TNFRSF10AO00220 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC29.52■■■□□ 2.32
TNFRSF10AO00220 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
TNFRSF10AO00220 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC29.51■■■□□ 2.31
TNFRSF10AO00220 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC29.5■■■□□ 2.31
TNFRSF10AO00220 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC29.5■■■□□ 2.31
TNFRSF10AO00220 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC29.49■■■□□ 2.31
TNFRSF10AO00220 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
TNFRSF10AO00220 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC29.48■■■□□ 2.31
TNFRSF10AO00220 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC29.48■■■□□ 2.31
TNFRSF10AO00220 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.47■■■□□ 2.31
TNFRSF10AO00220 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC29.46■■■□□ 2.31
TNFRSF10AO00220 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC29.45■■■□□ 2.31
TNFRSF10AO00220 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC29.45■■■□□ 2.31
TNFRSF10AO00220 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
TNFRSF10AO00220 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC29.42■■■□□ 2.3
TNFRSF10AO00220 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC29.42■■■□□ 2.3
TNFRSF10AO00220 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
TNFRSF10AO00220 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC29.39■■■□□ 2.3
TNFRSF10AO00220 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
TNFRSF10AO00220 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
TNFRSF10AO00220 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
TNFRSF10AO00220 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
TNFRSF10AO00220 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
TNFRSF10AO00220 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
TNFRSF10AO00220 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC29.34■■■□□ 2.29
TNFRSF10AO00220 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
TNFRSF10AO00220 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.31■■■□□ 2.28
TNFRSF10AO00220 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC29.3■■■□□ 2.28
TNFRSF10AO00220 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC29.3■■■□□ 2.28
TNFRSF10AO00220 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC29.29■■■□□ 2.28
TNFRSF10AO00220 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.26■■■□□ 2.28
TNFRSF10AO00220 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC29.26■■■□□ 2.27
TNFRSF10AO00220 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.25■■■□□ 2.27
TNFRSF10AO00220 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC29.25■■■□□ 2.27
TNFRSF10AO00220 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
TNFRSF10AO00220 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
TNFRSF10AO00220 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC29.23■■■□□ 2.27
TNFRSF10AO00220 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
TNFRSF10AO00220 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
TNFRSF10AO00220 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC29.19■■■□□ 2.26
TNFRSF10AO00220 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
TNFRSF10AO00220 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC29.18■■■□□ 2.26
TNFRSF10AO00220 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
TNFRSF10AO00220 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC29.12■■■□□ 2.25
TNFRSF10AO00220 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
TNFRSF10AO00220 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
TNFRSF10AO00220 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
TNFRSF10AO00220 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
TNFRSF10AO00220 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC29.09■■■□□ 2.25
TNFRSF10AO00220 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
TNFRSF10AO00220 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
TNFRSF10AO00220 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
TNFRSF10AO00220 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC29.08■■■□□ 2.25
TNFRSF10AO00220 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC29.07■■■□□ 2.24
TNFRSF10AO00220 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC29.06■■■□□ 2.24
TNFRSF10AO00220 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC29.06■■■□□ 2.24
TNFRSF10AO00220 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
TNFRSF10AO00220 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC29.03■■■□□ 2.24
TNFRSF10AO00220 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC29.03■■■□□ 2.24
TNFRSF10AO00220 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
TNFRSF10AO00220 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
TNFRSF10AO00220 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.23
TNFRSF10AO00220 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC29■■■□□ 2.23
TNFRSF10AO00220 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC29■■■□□ 2.23
TNFRSF10AO00220 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 7.6 ms