Protein–RNA interactions for Protein: H7C423

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 109 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H7C423 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
H7C423 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
H7C423 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
H7C423 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
H7C423 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
H7C423 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
H7C423 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
H7C423 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
H7C423 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
H7C423 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
H7C423 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
H7C423 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
H7C423 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC19.21■□□□□ 0.67
H7C423 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
H7C423 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
H7C423 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
H7C423 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
H7C423 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
H7C423 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC19.18■□□□□ 0.66
H7C423 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
H7C423 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
H7C423 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
H7C423 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
H7C423 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
H7C423 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
H7C423 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
H7C423 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
H7C423 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
H7C423 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
H7C423 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC19.14■□□□□ 0.65
H7C423 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
H7C423 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
H7C423 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
H7C423 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
H7C423 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
H7C423 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
H7C423 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
H7C423 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
H7C423 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
H7C423 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
H7C423 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
H7C423 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
H7C423 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
H7C423 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
H7C423 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
H7C423 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
H7C423 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
H7C423 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
H7C423 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
H7C423 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
H7C423 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
H7C423 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
H7C423 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
H7C423 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
H7C423 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
H7C423 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
H7C423 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
H7C423 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
H7C423 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
H7C423 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
H7C423 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
H7C423 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
H7C423 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
H7C423 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
H7C423 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
H7C423 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
H7C423 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
H7C423 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
H7C423 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
H7C423 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
H7C423 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
H7C423 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
H7C423 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
H7C423 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
H7C423 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
H7C423 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
H7C423 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
H7C423 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
H7C423 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
H7C423 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
H7C423 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
H7C423 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
H7C423 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
H7C423 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
H7C423 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
H7C423 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
H7C423 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
H7C423 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
H7C423 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
H7C423 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
H7C423 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
H7C423 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
H7C423 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
H7C423 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
H7C423 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
H7C423 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
H7C423 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
H7C423 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.61
H7C423 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
H7C423 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.9 ms