Protein–RNA interactions for Protein: C9J3I9

C5orf58, Putative uncharacterized protein C5orf58, humanhuman

Predictions only

Length 102 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C5orf58C9J3I9 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
C5orf58C9J3I9 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
C5orf58C9J3I9 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
C5orf58C9J3I9 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC25.98■■□□□ 1.75
C5orf58C9J3I9 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC25.97■■□□□ 1.75
C5orf58C9J3I9 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
C5orf58C9J3I9 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
C5orf58C9J3I9 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
C5orf58C9J3I9 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
C5orf58C9J3I9 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
C5orf58C9J3I9 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
C5orf58C9J3I9 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC25.92■■□□□ 1.74
C5orf58C9J3I9 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
C5orf58C9J3I9 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
C5orf58C9J3I9 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
C5orf58C9J3I9 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
C5orf58C9J3I9 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
C5orf58C9J3I9 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
C5orf58C9J3I9 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC25.89■■□□□ 1.74
C5orf58C9J3I9 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC25.89■■□□□ 1.74
C5orf58C9J3I9 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
C5orf58C9J3I9 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
C5orf58C9J3I9 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
C5orf58C9J3I9 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
C5orf58C9J3I9 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
C5orf58C9J3I9 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
C5orf58C9J3I9 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
C5orf58C9J3I9 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
C5orf58C9J3I9 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
C5orf58C9J3I9 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
C5orf58C9J3I9 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
C5orf58C9J3I9 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
C5orf58C9J3I9 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
C5orf58C9J3I9 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
C5orf58C9J3I9 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
C5orf58C9J3I9 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
C5orf58C9J3I9 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
C5orf58C9J3I9 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
C5orf58C9J3I9 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.81■■□□□ 1.72
C5orf58C9J3I9 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
C5orf58C9J3I9 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
C5orf58C9J3I9 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC25.8■■□□□ 1.72
C5orf58C9J3I9 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
C5orf58C9J3I9 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC25.79■■□□□ 1.72
C5orf58C9J3I9 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
C5orf58C9J3I9 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
C5orf58C9J3I9 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
C5orf58C9J3I9 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
C5orf58C9J3I9 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
C5orf58C9J3I9 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
C5orf58C9J3I9 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
C5orf58C9J3I9 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
C5orf58C9J3I9 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
C5orf58C9J3I9 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
C5orf58C9J3I9 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
C5orf58C9J3I9 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
C5orf58C9J3I9 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
C5orf58C9J3I9 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
C5orf58C9J3I9 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
C5orf58C9J3I9 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
C5orf58C9J3I9 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
C5orf58C9J3I9 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
C5orf58C9J3I9 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
C5orf58C9J3I9 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
C5orf58C9J3I9 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
C5orf58C9J3I9 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
C5orf58C9J3I9 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
C5orf58C9J3I9 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
C5orf58C9J3I9 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
C5orf58C9J3I9 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
C5orf58C9J3I9 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
C5orf58C9J3I9 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
C5orf58C9J3I9 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
C5orf58C9J3I9 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
C5orf58C9J3I9 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
C5orf58C9J3I9 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC25.56■■□□□ 1.68
C5orf58C9J3I9 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
C5orf58C9J3I9 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
C5orf58C9J3I9 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
C5orf58C9J3I9 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
C5orf58C9J3I9 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
C5orf58C9J3I9 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
C5orf58C9J3I9 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
C5orf58C9J3I9 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
C5orf58C9J3I9 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
C5orf58C9J3I9 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
C5orf58C9J3I9 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
C5orf58C9J3I9 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
C5orf58C9J3I9 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC25.46■■□□□ 1.67
C5orf58C9J3I9 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
C5orf58C9J3I9 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
C5orf58C9J3I9 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
C5orf58C9J3I9 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
C5orf58C9J3I9 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
C5orf58C9J3I9 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
C5orf58C9J3I9 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
C5orf58C9J3I9 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
C5orf58C9J3I9 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
C5orf58C9J3I9 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
C5orf58C9J3I9 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.5 ms