Protein–RNA interactions for Protein: B4DZS4

TCP11X1, T-complex protein 11 X-linked protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 312 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCP11X1B4DZS4 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
TCP11X1B4DZS4 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
TCP11X1B4DZS4 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
TCP11X1B4DZS4 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
TCP11X1B4DZS4 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC28.05■■■□□ 2.08
TCP11X1B4DZS4 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
TCP11X1B4DZS4 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
TCP11X1B4DZS4 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
TCP11X1B4DZS4 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
TCP11X1B4DZS4 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
TCP11X1B4DZS4 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
TCP11X1B4DZS4 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
TCP11X1B4DZS4 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
TCP11X1B4DZS4 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
TCP11X1B4DZS4 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC27.89■■■□□ 2.06
TCP11X1B4DZS4 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
TCP11X1B4DZS4 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
TCP11X1B4DZS4 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
TCP11X1B4DZS4 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
TCP11X1B4DZS4 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
TCP11X1B4DZS4 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
TCP11X1B4DZS4 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC27.83■■■□□ 2.05
TCP11X1B4DZS4 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
TCP11X1B4DZS4 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
TCP11X1B4DZS4 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
TCP11X1B4DZS4 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
TCP11X1B4DZS4 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
TCP11X1B4DZS4 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
TCP11X1B4DZS4 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
TCP11X1B4DZS4 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
TCP11X1B4DZS4 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
TCP11X1B4DZS4 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
TCP11X1B4DZS4 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
TCP11X1B4DZS4 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
TCP11X1B4DZS4 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
TCP11X1B4DZS4 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
TCP11X1B4DZS4 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
TCP11X1B4DZS4 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
TCP11X1B4DZS4 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
TCP11X1B4DZS4 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC27.7■■■□□ 2.02
TCP11X1B4DZS4 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
TCP11X1B4DZS4 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
TCP11X1B4DZS4 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
TCP11X1B4DZS4 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
TCP11X1B4DZS4 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
TCP11X1B4DZS4 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
TCP11X1B4DZS4 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
TCP11X1B4DZS4 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
TCP11X1B4DZS4 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
TCP11X1B4DZS4 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
TCP11X1B4DZS4 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
TCP11X1B4DZS4 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
TCP11X1B4DZS4 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
TCP11X1B4DZS4 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
TCP11X1B4DZS4 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
TCP11X1B4DZS4 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
TCP11X1B4DZS4 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
TCP11X1B4DZS4 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC27.6■■■□□ 2.01
TCP11X1B4DZS4 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
TCP11X1B4DZS4 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
TCP11X1B4DZS4 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
TCP11X1B4DZS4 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
TCP11X1B4DZS4 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
TCP11X1B4DZS4 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
TCP11X1B4DZS4 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
TCP11X1B4DZS4 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
TCP11X1B4DZS4 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC27.53■■■□□ 2
TCP11X1B4DZS4 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
TCP11X1B4DZS4 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
TCP11X1B4DZS4 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
TCP11X1B4DZS4 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
TCP11X1B4DZS4 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
TCP11X1B4DZS4 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
TCP11X1B4DZS4 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
TCP11X1B4DZS4 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC27.49■■□□□ 1.99
TCP11X1B4DZS4 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
TCP11X1B4DZS4 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
TCP11X1B4DZS4 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
TCP11X1B4DZS4 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
TCP11X1B4DZS4 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
TCP11X1B4DZS4 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
TCP11X1B4DZS4 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
TCP11X1B4DZS4 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
TCP11X1B4DZS4 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
TCP11X1B4DZS4 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
TCP11X1B4DZS4 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
TCP11X1B4DZS4 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
TCP11X1B4DZS4 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
TCP11X1B4DZS4 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
TCP11X1B4DZS4 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
TCP11X1B4DZS4 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
TCP11X1B4DZS4 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
TCP11X1B4DZS4 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC27.37■■□□□ 1.97
TCP11X1B4DZS4 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
TCP11X1B4DZS4 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
TCP11X1B4DZS4 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
TCP11X1B4DZS4 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
TCP11X1B4DZS4 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
TCP11X1B4DZS4 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
TCP11X1B4DZS4 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC27.35■■□□□ 1.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.2 ms