Protein–RNA interactions for Protein: A8MW95

BECN2, Beclin-2, humanhuman

Predictions only

Length 431 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BECN2A8MW95 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC31.22■■■□□ 2.59
BECN2A8MW95 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.22■■■□□ 2.59
BECN2A8MW95 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.21■■■□□ 2.59
BECN2A8MW95 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.2■■■□□ 2.58
BECN2A8MW95 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.2■■■□□ 2.58
BECN2A8MW95 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC31.18■■■□□ 2.58
BECN2A8MW95 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC31.18■■■□□ 2.58
BECN2A8MW95 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC31.17■■■□□ 2.58
BECN2A8MW95 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.15■■■□□ 2.58
BECN2A8MW95 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.15■■■□□ 2.58
BECN2A8MW95 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.15■■■□□ 2.58
BECN2A8MW95 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC31.12■■■□□ 2.57
BECN2A8MW95 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.1■■■□□ 2.57
BECN2A8MW95 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.1■■■□□ 2.57
BECN2A8MW95 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.09■■■□□ 2.57
BECN2A8MW95 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC31.08■■■□□ 2.57
BECN2A8MW95 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
BECN2A8MW95 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC31.07■■■□□ 2.56
BECN2A8MW95 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.07■■■□□ 2.56
BECN2A8MW95 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
BECN2A8MW95 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
BECN2A8MW95 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
BECN2A8MW95 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
BECN2A8MW95 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
BECN2A8MW95 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
BECN2A8MW95 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
BECN2A8MW95 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC30.97■■■□□ 2.55
BECN2A8MW95 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
BECN2A8MW95 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC30.94■■■□□ 2.54
BECN2A8MW95 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC30.93■■■□□ 2.54
BECN2A8MW95 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC30.91■■■□□ 2.54
BECN2A8MW95 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.54
BECN2A8MW95 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.89■■■□□ 2.54
BECN2A8MW95 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.53
BECN2A8MW95 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC30.88■■■□□ 2.53
BECN2A8MW95 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.88■■■□□ 2.53
BECN2A8MW95 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC30.87■■■□□ 2.53
BECN2A8MW95 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
BECN2A8MW95 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
BECN2A8MW95 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
BECN2A8MW95 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
BECN2A8MW95 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC30.85■■■□□ 2.53
BECN2A8MW95 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
BECN2A8MW95 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
BECN2A8MW95 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC30.83■■■□□ 2.53
BECN2A8MW95 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC30.83■■■□□ 2.53
BECN2A8MW95 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
BECN2A8MW95 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
BECN2A8MW95 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
BECN2A8MW95 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
BECN2A8MW95 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
BECN2A8MW95 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.52
BECN2A8MW95 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.51
BECN2A8MW95 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC30.76■■■□□ 2.51
BECN2A8MW95 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
BECN2A8MW95 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
BECN2A8MW95 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
BECN2A8MW95 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
BECN2A8MW95 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC30.73■■■□□ 2.51
BECN2A8MW95 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
BECN2A8MW95 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC30.72■■■□□ 2.51
BECN2A8MW95 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
BECN2A8MW95 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC30.7■■■□□ 2.5
BECN2A8MW95 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC30.7■■■□□ 2.5
BECN2A8MW95 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.69■■■□□ 2.5
BECN2A8MW95 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC30.68■■■□□ 2.5
BECN2A8MW95 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC30.68■■■□□ 2.5
BECN2A8MW95 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.67■■■□□ 2.5
BECN2A8MW95 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.67■■■□□ 2.5
BECN2A8MW95 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.67■■■□□ 2.5
BECN2A8MW95 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.67■■■□□ 2.5
BECN2A8MW95 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.65■■■□□ 2.5
BECN2A8MW95 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.64■■■□□ 2.5
BECN2A8MW95 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.64■■■□□ 2.49
BECN2A8MW95 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
BECN2A8MW95 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.62■■■□□ 2.49
BECN2A8MW95 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
BECN2A8MW95 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
BECN2A8MW95 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
BECN2A8MW95 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC30.59■■■□□ 2.49
BECN2A8MW95 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
BECN2A8MW95 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC30.59■■■□□ 2.49
BECN2A8MW95 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.59■■■□□ 2.49
BECN2A8MW95 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.58■■■□□ 2.49
BECN2A8MW95 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC30.58■■■□□ 2.49
BECN2A8MW95 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC30.58■■■□□ 2.49
BECN2A8MW95 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
BECN2A8MW95 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
BECN2A8MW95 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC30.56■■■□□ 2.48
BECN2A8MW95 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
BECN2A8MW95 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC30.53■■■□□ 2.48
BECN2A8MW95 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
BECN2A8MW95 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
BECN2A8MW95 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
BECN2A8MW95 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
BECN2A8MW95 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.52■■■□□ 2.48
BECN2A8MW95 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
BECN2A8MW95 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
BECN2A8MW95 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
BECN2A8MW95 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.2 ms