Protein–RNA interactions for Protein: A8MPY1

GABRR3, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit rho-3, humanhuman

Predictions only

Length 467 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABRR3A8MPY1 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
GABRR3A8MPY1 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.84
GABRR3A8MPY1 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.84
GABRR3A8MPY1 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.57■■□□□ 1.84
GABRR3A8MPY1 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
GABRR3A8MPY1 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC26.56■■□□□ 1.84
GABRR3A8MPY1 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC26.56■■□□□ 1.84
GABRR3A8MPY1 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
GABRR3A8MPY1 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
GABRR3A8MPY1 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
GABRR3A8MPY1 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
GABRR3A8MPY1 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
GABRR3A8MPY1 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
GABRR3A8MPY1 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC26.51■■□□□ 1.83
GABRR3A8MPY1 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
GABRR3A8MPY1 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
GABRR3A8MPY1 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
GABRR3A8MPY1 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
GABRR3A8MPY1 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC26.49■■□□□ 1.83
GABRR3A8MPY1 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
GABRR3A8MPY1 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
GABRR3A8MPY1 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
GABRR3A8MPY1 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
GABRR3A8MPY1 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
GABRR3A8MPY1 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC26.45■■□□□ 1.82
GABRR3A8MPY1 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
GABRR3A8MPY1 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
GABRR3A8MPY1 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
GABRR3A8MPY1 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
GABRR3A8MPY1 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
GABRR3A8MPY1 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
GABRR3A8MPY1 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
GABRR3A8MPY1 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC26.42■■□□□ 1.82
GABRR3A8MPY1 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
GABRR3A8MPY1 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC26.41■■□□□ 1.82
GABRR3A8MPY1 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
GABRR3A8MPY1 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
GABRR3A8MPY1 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.81
GABRR3A8MPY1 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.81
GABRR3A8MPY1 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC26.37■■□□□ 1.81
GABRR3A8MPY1 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
GABRR3A8MPY1 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
GABRR3A8MPY1 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
GABRR3A8MPY1 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.36■■□□□ 1.81
GABRR3A8MPY1 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC26.36■■□□□ 1.81
GABRR3A8MPY1 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
GABRR3A8MPY1 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
GABRR3A8MPY1 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
GABRR3A8MPY1 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC26.32■■□□□ 1.8
GABRR3A8MPY1 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
GABRR3A8MPY1 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC26.3■■□□□ 1.8
GABRR3A8MPY1 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC26.29■■□□□ 1.8
GABRR3A8MPY1 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
GABRR3A8MPY1 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
GABRR3A8MPY1 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
GABRR3A8MPY1 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
GABRR3A8MPY1 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
GABRR3A8MPY1 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
GABRR3A8MPY1 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
GABRR3A8MPY1 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC26.23■■□□□ 1.79
GABRR3A8MPY1 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
GABRR3A8MPY1 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
GABRR3A8MPY1 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
GABRR3A8MPY1 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC26.22■■□□□ 1.79
GABRR3A8MPY1 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
GABRR3A8MPY1 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
GABRR3A8MPY1 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
GABRR3A8MPY1 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
GABRR3A8MPY1 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
GABRR3A8MPY1 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
GABRR3A8MPY1 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
GABRR3A8MPY1 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
GABRR3A8MPY1 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
GABRR3A8MPY1 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
GABRR3A8MPY1 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
GABRR3A8MPY1 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
GABRR3A8MPY1 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
GABRR3A8MPY1 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
GABRR3A8MPY1 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
GABRR3A8MPY1 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC26.14■■□□□ 1.78
GABRR3A8MPY1 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
GABRR3A8MPY1 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
GABRR3A8MPY1 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
GABRR3A8MPY1 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
GABRR3A8MPY1 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
GABRR3A8MPY1 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC26.11■■□□□ 1.77
GABRR3A8MPY1 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
GABRR3A8MPY1 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
GABRR3A8MPY1 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
GABRR3A8MPY1 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
GABRR3A8MPY1 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
GABRR3A8MPY1 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
GABRR3A8MPY1 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
GABRR3A8MPY1 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
GABRR3A8MPY1 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC26.04■■□□□ 1.76
GABRR3A8MPY1 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
GABRR3A8MPY1 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
GABRR3A8MPY1 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
GABRR3A8MPY1 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC26.02■■□□□ 1.76
GABRR3A8MPY1 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.5 ms